Genas
RAX2
retina and anterior neural fold homeobox 2
- HGNC 18286↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000173976↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 84839↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 19p13.3
- Koordinatės
- Chromosoma 19: 3 769 089–3 772 228 (GRCh38)
- Eksonai
- 3 eksonų per 3,1 kb
- Baltymas
- 184 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- MGC15631, ARMD6, CORD11
- Ankstesni simboliai
- RAXL1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000555633.3NM_001319074.4
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/rax2.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite RAX2 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Retinitis pigmentosa
Vienas iš 77 su juo susijusių genų
Paveldimų tinklainės distrofijų grupė, kuriai būdingas progresuojantis lazdelių, o vėliau kolbelių fotoreceptorių netekimas, sukeliantis naktinį aklumą ir palaipsnį periferinio regėjimo praradimą.
- 2 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas RAX2
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 2,4 kb iš 3,1 kb geno; 555 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: RAX2
7Maža
Kiek sunku sekti RAX2 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo RAX2 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.2,4 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.71 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
3
RAX2 pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 3,1 kb geno RAX2, įskaitant intronus, o ne tik 2,4 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Turi 1 bendrą būklę
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Turi 1 bendrą būklę
- AHRaryl hydrocarbon receptorTuri 1 bendrą būklę
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Turi 1 bendrą būklę
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinTuri 1 bendrą būklę
- ARL3ARF like GTPase 3Turi 1 bendrą būklę
- ARL6ARF like GTPase 6Turi 1 bendrą būklę
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Turi 1 bendrą būklę
- BEST1bestrophin 1Turi 1 bendrą būklę
- CA4carbonic anhydrase 4Turi 1 bendrą būklę
- CC2D2Acoiled-coil and C2 domain containing 2ATuri 1 bendrą būklę
- CDHR1cadherin related family member 1Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su RAX2
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti RAX2, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Limited peripheral vision
- Abnormal retinal pigmentation
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Optic disc pallor
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
Rodyti dar 14 savybių
- Blind spot located at fixation point
- Color blindness
- Perifoveal ring of hyperautofluorescence
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Metamorphopsia
- Visual impairment
- Bull's eye maculopathy
- Cone/cone-rod dystrophy
- Macular atrophy
- Macular degeneration
- Slow decrease in sharpness of vision
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-e609d43e.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). RAX2 genas: retina and anterior neural fold homeobox 2. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/rax2
Dante Labs. RAX2 genas: retina and anterior neural fold homeobox 2 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/rax2
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites