Genas
MSH6
mutS homolog 6
- HGNC 7329↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000116062↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 2956↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 2p16.3
- Koordinatės
- Chromosoma 2: 47 783 145–47 806 953 (GRCh38)
- Eksonai
- 10 eksonų per 23,8 kb
- Baltymas
- 1 360 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis Autosominis recesyvinis
- Taip pat žinomas kaip
- MSH-6
- Ankstesni simboliai
- GTBP
- MANE Select transkriptas
- ENST00000234420.11NM_000179.3
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite MSH6 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
DNA taisymo sutrikimo liga
- Autosominis recesyvinis
Liga, kurios pagrindas – DNR taisymo mechanizmo sutrikimas.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Lynch sindromas
- Autosominis dominantinis
Paveldima nepolipinė storosios žarnos vėžio sindromas, kurį sukelia germinalinės nesutapimų taisymo defektai, pasireiškiantis ankstyvo amžiaus storosios žarnos, gimdos gleivinės ir kitais vėžiais.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 5 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių rezultatų sąrašą
Ką duoda žinojimas
Sustiprinta kolonoskopijos priežiūra, aspirino chemoprevencija, imuninio kontrolinio taško inhibitoriai MSI-high navikams, kaskadinis tyrimas, rizikos mažinimo ginekologinė chirurgija
Paveldėjimas
- Autosominis dominantinis
- Pakanka vieno pakitusio egzemplioriaus iš bet kurio iš tėvų. Tėvas ar motina, turintys tokį pakitimą, perduoda jį kiekvienam vaikui su vienos iš dviejų tikimybe.
- Autosominis recesyvinis
- Reikia pakitusio egzemplioriaus iš kiekvieno iš tėvų. Turint vieną, esate nešiotojas ir paprastai neturite požymių; kai abu tėvai yra nešiotojai, kiekvienas vaikas su vienos iš keturių tikimybe paveldės du.
Kaip išdėstytas MSH6
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,3 kb iš 23,8 kb geno; 4 083 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito MSH6
1 414
MSH6 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 23,8 kb MSH6 geno, įskaitant intronus, o ne tik 4,3 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (274)
Čia pateikiami MSH6 variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A794Hfs*9 | c.2379_2380del | Eksonas 4 | 47 800 361 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A1055P | c.3163G>C | Eksonas 4 | 47 801 146 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A1236Efs*2 | c.3678_3706dup | Eksonas 8 | 47 806 234 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A1320Efs*6 | c.3959_3962del | Eksonas 9 | 47 806 605 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A1320Sfs*5 | c.3939_3957dup | Eksonas 9 | 47 806 588 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| c.3G>T | Eksonas 1 | 47 783 236 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.457+2T>A | Intronas 2 | 47 791 125 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.458-1G>A | Intronas 2 | 47 795 893 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.642C>G | Eksonas 4 | 47 798 625 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.652A>T | Eksonas 4 | 47 798 635 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- MLH1mutL homolog 1Turi 2 bendrų būklių
- MSH2mutS homolog 2Turi 2 bendrų būklių
- PMS2PMS1 homolog 2, mismatch repair system componentTuri 2 bendrų būklių
- APTXaprataxinTuri 1 bendrą būklę
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedTuri 1 bendrą būklę
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedTuri 1 bendrą būklę
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Turi 1 bendrą būklę
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Turi 1 bendrą būklę
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CTuri 1 bendrą būklę
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Turi 1 bendrą būklę
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeTuri 1 bendrą būklę
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su MSH6
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti MSH6, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Astrocytoma
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
Rodyti dar 16 savybių
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). MSH6 genas: mutS homolog 6. Pasiekta 2026 m. spalio 16 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/msh6
Dante Labs. MSH6 genas: mutS homolog 6 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 16 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/msh6
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites