Gen
MSH6
mutS homolog 6
- HGNC 7329↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000116062↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 2956↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 2p16.3
- Współrzędne
- Chromosom 2: 47 783 145–47 806 953 (GRCh38)
- Eksony
- 10 eksonów na odcinku 23,8 kb
- Białko
- 1360 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące Autosomalne recesywne
- Znany również jako
- MSH-6
- Poprzednie symbole
- GTBP
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000234420.11NM_000179.3
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj MSH6 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Choroba naprawy DNA
- Autosomalne recesywne
Choroba, której podłożem jest zaburzenie mechanizmów naprawy DNA.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Zespół Lyncha
- Autosomalne dominujące
Dziedziczny niepolipowaty rak jelita grubego, wywołany zarodkowymi defektami naprawy niedopasowań, z wczesnym występowaniem raka jelita grubego, trzonu macicy i innych nowotworów.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Rozszerzona kontrola kolonoskopowa, profilaktyka aspiryną, inhibitory punktów kontrolnych odporności w guzach o wysokiej niestabilności mikrosatelitarnej (MSI-high), kaskadowe badania krewnych, zabiegi ginekologiczne zmniejszające ryzyko
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
- Autosomalne recesywne
- Potrzebna jest zmieniona kopia od każdego z rodziców. Przy jednej zmienionej kopii osoba jest nosicielem i zwykle nie ma objawów; gdy oboje rodzice są nosicielami, każde dziecko ma szansę jeden do czterech odziedziczyć dwie kopie.
Budowa genu MSH6
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 4,3 kb z 23,8 kb genu; 4083 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje MSH6
1414
pozycje w MSH6, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 23,8 kb genu MSH6, łącznie z intronami, a nie tylko 4,3 kb eksonów.
Warianty z podstroną (274)
Warianty MSH6 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A794Hfs*9 | c.2379_2380del | Ekson 4 | 47 800 361 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A1055P | c.3163G>C | Ekson 4 | 47 801 146 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A1236Efs*2 | c.3678_3706dup | Ekson 8 | 47 806 234 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A1320Efs*6 | c.3959_3962del | Ekson 9 | 47 806 605 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A1320Sfs*5 | c.3939_3957dup | Ekson 9 | 47 806 588 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.3G>T | Ekson 1 | 47 783 236 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.457+2T>A | Intron 2 | 47 791 125 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.458-1G>A | Intron 2 | 47 795 893 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.642C>G | Ekson 4 | 47 798 625 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.652A>T | Ekson 4 | 47 798 635 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- MLH1mutL homolog 1Wspólnych schorzeń: 2
- MSH2mutS homolog 2Wspólnych schorzeń: 2
- PMS2PMS1 homolog 2, mismatch repair system componentWspólnych schorzeń: 2
- APTXaprataxinWspólne schorzenie: 1
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedWspólne schorzenie: 1
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedWspólne schorzenie: 1
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Wspólne schorzenie: 1
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Wspólne schorzenie: 1
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CWspólne schorzenie: 1
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Wspólne schorzenie: 1
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeWspólne schorzenie: 1
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem MSH6
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać MSH6. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Astrocytoma
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
Pokaż jeszcze 16 cech
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen MSH6: mutS homolog 6. Pobrano 16 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/msh6
Dante Labs. Gen MSH6: mutS homolog 6 [Internet]. [cytowano 16 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/msh6
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni