Gen
MSH6
mutS homolog 6
- HGNC 7329↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000116062↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 2956↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2p16.3
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 47.783.145–47.806.953 (GRCh38)
- Exons
- 10 exons over 23,8 kb
- Eiwit
- 1.360 aminozuren
- Overerving
- Autosomaal dominant Autosomaal recessief
- Ook bekend als
- MSH-6
- Eerdere symbolen
- GTBP
- MANE Select-transcript
- ENST00000234420.11NM_000179.3
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees MSH6 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
DNA-herstelziekte
- Autosomaal recessief
Een ziekte die zijn oorsprong heeft in een verstoring van het herstel van DNA.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Lynch-syndroom
- Autosomaal dominant
Erfelijk niet-polyposis colorectaal kankersyndroom, veroorzaakt door kiembaandefecten in mismatchreparatiegenen, met vroeg optredende darm-, baarmoeder- en andere kankers.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 5 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Op de ACMG-lijst met secundaire bevindingen
Wat weten verandert
Uitgebreide darmonderzoeken (coloscopie) met verhoogde frequentie, aspirine als chemopreventie, immuuncheckpointremmers voor MSI-hoge tumoren, familieonderzoek (cascadetesten) en risicoverlagende gynaecologische operaties
Overerving
- Autosomaal dominant
- Eén veranderde kopie, van welke ouder dan ook, is voldoende. Een ouder die er één heeft, geeft die met een kans van één op twee door aan elk kind.
- Autosomaal recessief
- Er is een veranderde kopie van elke ouder nodig. Met één bent u drager en meestal niet aangedaan. Wanneer beide ouders dragers zijn, heeft elk kind een kans van één op vier om er twee te erven.
Opbouw van MSH6
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 4,3 kb van de 23,8 kb van het gen; 4.083 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest MSH6 leest
1.414
posities in MSH6 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 23,8 kb van MSH6, inclusief introns, en niet alleen de 4,3 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (274)
De MSH6-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A794Hfs*9 | c.2379_2380del | Exon 4 | 47.800.361 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| A1055P | c.3163G>C | Exon 4 | 47.801.146 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| A1236Efs*2 | c.3678_3706dup | Exon 8 | 47.806.234 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| A1320Efs*6 | c.3959_3962del | Exon 9 | 47.806.605 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| A1320Sfs*5 | c.3939_3957dup | Exon 9 | 47.806.588 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.3G>T | Exon 1 | 47.783.236 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.457+2T>A | Intron 2 | 47.791.125 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.458-1G>A | Intron 2 | 47.795.893 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.642C>G | Exon 4 | 47.798.625 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.652A>T | Exon 4 | 47.798.635 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- MLH1mutL homolog 1Deelt 2 aandoeningen
- MSH2mutS homolog 2Deelt 2 aandoeningen
- PMS2PMS1 homolog 2, mismatch repair system componentDeelt 2 aandoeningen
- APTXaprataxinDeelt 1 aandoening
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedDeelt 1 aandoening
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedDeelt 1 aandoening
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Deelt 1 aandoening
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Deelt 1 aandoening
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CDeelt 1 aandoening
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Deelt 1 aandoening
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeDeelt 1 aandoening
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan MSH6
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die MSH6 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Astrocytoma
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
Toon 16 kenmerken meer
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). MSH6-gen: mutS homolog 6. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/msh6
Dante Labs. MSH6-gen: mutS homolog 6 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/msh6
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken