Gen
MSH6
mutS homolog 6
- HGNC 7329↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000116062↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 2956↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 2p16.3
- Koordinatlar
- Kromozom 2: 47.783.145–47.806.953 (GRCh38)
- Eksonlar
- 23,8 kb boyunca 10 ekson
- Protein
- 1.360 amino asit
- Kalıtım
- Otozomal dominant Otozomal resesif
- Diğer adları
- MSH-6
- Önceki semboller
- GTBP
- MANE Select transkripti
- ENST00000234420.11NM_000179.3
- Lokus türü
- gene with protein product
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Referans genomGRCh38hg38
Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.
MSH6 ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili raporlar
DNA Onarım Hastalığı
- Otozomal resesif
DNA onarımının bozulmasına dayanan bir hastalık.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 4 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
Lynch Sendromu
- Otozomal dominant
Germline DNA uyumsuzluk onarımı kusurlarından kaynaklanan, erken yaşta kolorektal, endometriyal ve diğer kanserlerle seyreden kalıtsal polipsiz kolorektal kanser sendromudur.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 5 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
- ACMG ikincil bulgular listesinde
Bilmenin neleri değiştirdiği
Gelişmiş kolonoskopi takibi, aspirin ile kemoprevansiyon, MSI-yüksek tümörlerde immün kontrol noktası inhibitörleri, kaskad testi, riski azaltıcı jinekolojik cerrahi
Kalıtım
- Otozomal dominant
- Ebeveynlerden birinden gelen tek bir değişmiş kopya yeterlidir. Değişmiş kopyaya sahip bir ebeveyn, bunu her çocuğuna ikide bir olasılıkla aktarır.
- Otozomal resesif
- Her iki ebeveynden birer değişmiş kopya gerekir. Tek bir değişmiş kopyayla taşıyıcı olursunuz ve genellikle etkilenmezsiniz; her iki ebeveyn de taşıyıcıysa, her çocuğun ikisini birden miras alma olasılığı dörtte birdir.
MSH6 geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
- Sayfası olan varyantlar
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 23,8 kb uzunluğunun 4,3 kb'sini oluşturur; bu bazların 4.083 tanesi proteini kodlar.
Bir genom testi MSH6 genini nasıl okur
1.414
MSH6 içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar
Bunların hiçbiri, kısa okumaların zorlandığı bir bölgeye düşmüyor.
Tam genom, MSH6 genindeki 23,8 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 4,3 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.
Sayfası olan varyantlar (274)
Burada sayfası bulunan MSH6 varyantları, en çok inceleme yıldızına sahip olanlar önce gelecek şekilde listelenmiştir. Her sayfa, varyantla ilgili ClinVar'ın kamuya açık kaydını açıklar; hiçbir zaman bir sonuç değildir.
| Varyant | HGVS c. | Ekzon veya intron | Konum (GRCh38) | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|---|---|
| A794Hfs*9 | c.2379_2380del | Ekzon 4 | 47.800.361 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| A1055P | c.3163G>C | Ekzon 4 | 47.801.146 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| A1236Efs*2 | c.3678_3706dup | Ekzon 8 | 47.806.234 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| A1320Efs*6 | c.3959_3962del | Ekzon 9 | 47.806.605 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| A1320Sfs*5 | c.3939_3957dup | Ekzon 9 | 47.806.588 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| c.3G>T | Ekzon 1 | 47.783.236 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.457+2T>A | İntron 2 | 47.791.125 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.458-1G>A | İntron 2 | 47.795.893 | Muhtemelen patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.642C>G | Ekzon 4 | 47.798.625 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş | |
| c.652A>T | Ekzon 4 | 47.798.635 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
Aynı durumlarla ilişkili genler
- MLH1mutL homolog 12 durumu paylaşıyor
- MSH2mutS homolog 22 durumu paylaşıyor
- PMS2PMS1 homolog 2, mismatch repair system component2 durumu paylaşıyor
- APTXaprataxin1 durumu paylaşıyor
- BRCA1BRCA1 DNA repair associated1 durumu paylaşıyor
- BRCA2BRCA2 DNA repair associated1 durumu paylaşıyor
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 11 durumu paylaşıyor
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 71 durumu paylaşıyor
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1C1 durumu paylaşıyor
- DDB2damage specific DNA binding protein 21 durumu paylaşıyor
- EPCAMepithelial cell adhesion molecule1 durumu paylaşıyor
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunit1 durumu paylaşıyor
MSH6 ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, MSH6 geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Astrocytoma
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
16 özellik daha göster
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-16 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). MSH6 geni: mutS homolog 6. Erişim tarihi: 16 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/msh6
Dante Labs. MSH6 geni: mutS homolog 6 [Internet]. [alıntı tarihi 16 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/msh6
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde