Gen
MSH6
mutS homolog 6
- HGNC 7329↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000116062↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 2956↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2p16.3
- Koordinater
- Kromosom 2: 47.783.145–47.806.953 (GRCh38)
- Exoner
- 10 exoner fordelt over 23,8 kb
- Protein
- 1.360 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant Autosomal recessiv
- Også kendt som
- MSH-6
- Tidligere symboler
- GTBP
- MANE Select-transkript
- ENST00000234420.11NM_000179.3
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs MSH6 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
DNA-reparationssygdom
- Autosomal recessiv
En sygdom, der har sin baggrund i forstyrrelse af DNA-reparation.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Lynch-syndrom
- Autosomal dominant
Hereditært nonpolypøst tyktarmskræftsyndrom forårsaget af arvelige defekter i misparringsreparation, med tidligt opstået tyktarms-, endometrie- og andre kræftformer.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- På ACMG's liste over sekundære fund
Hvad viden ændrer
Forstærket koloskopiovervågning, kemoprofylakse med acetylsalicylsyre, immunkontrolhæmmere mod MSI-høje tumorer, kaskadetestning, risikoreducerende gynækologisk kirurgi
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
- Autosomal recessiv
- Det kræver en ændret kopi fra hver forælder. Med én er man bærer og som regel upåvirket; når begge forældre er bærere, har hvert barn en chance på en ud af fire for at arve to.
Sådan er MSH6 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 4,3 kb af genets 23,8 kb; 4.083 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest MSH6
1.414
positioner i MSH6, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 23,8 kb af MSH6, inklusive introner, og ikke kun de 4,3 kb eksoner.
Varianter med en side (274)
Her vises de MSH6-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A794Hfs*9 | c.2379_2380del | Exon 4 | 47.800.361 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| A1055P | c.3163G>C | Exon 4 | 47.801.146 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| A1236Efs*2 | c.3678_3706dup | Exon 8 | 47.806.234 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| A1320Efs*6 | c.3959_3962del | Exon 9 | 47.806.605 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| A1320Sfs*5 | c.3939_3957dup | Exon 9 | 47.806.588 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| c.3G>T | Exon 1 | 47.783.236 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.457+2T>A | Intron 2 | 47.791.125 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.458-1G>A | Intron 2 | 47.795.893 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.642C>G | Exon 4 | 47.798.625 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.652A>T | Exon 4 | 47.798.635 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- MLH1mutL homolog 1Deler 2 sygdomme
- MSH2mutS homolog 2Deler 2 sygdomme
- PMS2PMS1 homolog 2, mismatch repair system componentDeler 2 sygdomme
- APTXaprataxinDeler 1 sygdom
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedDeler 1 sygdom
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedDeler 1 sygdom
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Deler 1 sygdom
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Deler 1 sygdom
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CDeler 1 sygdom
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Deler 1 sygdom
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeDeler 1 sygdom
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitDeler 1 sygdom
Træk knyttet til MSH6
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, MSH6 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Astrocytoma
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
Vis 16 træk mere
- Migraine
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). MSH6-genet: mutS homolog 6. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/msh6
Dante Labs. MSH6-genet: mutS homolog 6 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/msh6
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger