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Gene

TRMT10A

tRNA methyltransferase 10A

Sintesi

Localizzazione citogenetica
4q23
Coordinate
Cromosoma 4: 99.546.711–99.564.039 (GRCh38)
Esoni
8 esoni su 17,3 kb
Proteina
339 amminoacidi
Noto anche come
MGC27034, TRM10
Simboli precedenti
RG9MTD2
Trascritto MANE Select
ENST00000394876.7NM_001134665.3
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curati rilevanti per questo gene

Nessun report del Genome Test legge ancora TRMT10A. Il test sequenzia l'intero genoma, quindi i suoi dati lo includono comunque.

Struttura di TRMT10A

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 4, con una parentesi dove si trova TRMT10A. TRMT10A e 15 geni nelle vicinanze sul cromosoma 4, da 99.055.375 a 100.055.374.Cromosoma 44q23p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.299,2 Mb99,4 Mb99,6 Mb99,8 Mb100 MbMETAP1: 98.995.359–99.065.059, filamento direttoMETAP1ADH5: 99.070.978–99.088.822, filamento inversoADH5ADH4: 99.123.502–99.157.792, filamento inversoADH4ADH6: 99.202.424–99.219.537, filamento inversoADH6ADH1A: 99.275.958–99.291.552, filamento inversoADH1AADH1B: 99.304.971–99.321.659, filamento inversoADH1BADH1C: 99.336.093–99.382.896, filamento inversoADH1CADH7: 99.412.261–99.435.698, filamento inversoADH7C4orf17: 99.511.012–99.542.303, filamento direttoC4orf17TRMT10A: 99.546.711–99.564.039, filamento inversoTRMT10AMTTP: 99.564.081–99.623.997, filamento direttoMTTPC4orf54: 99.636.529–99.657.828, filamento inversoC4orf54DAPP1: 99.816.729–99.872.335, filamento direttoDAPP1LAMTOR3: 99.874.948–99.894.428, filamento inversoLAMTOR3DNAJB14: 99.896.248–99.946.726, filamento inversoDNAJB14H2AZ1: 99.948.051–99.950.540, filamento inversoH2AZ1Diagramma di TRMT10A: 8 esoni sul filamento inverso del cromosoma 4Esone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 4: 2 siti noti causativi di malattiaEsone 3: 4 siti noti causativi di malattiaEsone 2: 4 siti noti causativi di malattiaEsone 8: 99.546.711–99.549.356, 2646 basiEsone 7: 99.550.885–99.550.990, 106 basiEsone 6: 99.553.785–99.553.934, 150 basiEsone 5: 99.556.146–99.556.220, 75 basiEsone 4: 99.557.345–99.557.416, 72 basiEsone 3: 99.558.049–99.558.211, 163 basiEsone 2: 99.559.154–99.559.361, 208 basiEsone 1: 99.563.913–99.564.039, 127 basi876543215′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 3,5 kb dei 17,3 kb del gene; 1020 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge TRMT10A

14

posizioni in TRMT10A in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

2 di esse (14%) si trovano in regioni che le letture brevi faticano a leggere.

  • Low mappability (2 siti)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.

Un genoma intero copre tutti i 17,3 kb di TRMT10A, introni inclusi, non solo i 3,5 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene TRMT10A: tRNA methyltransferase 10A. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/trmt10a

Vancouver

Dante Labs. Gene TRMT10A: tRNA methyltransferase 10A [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/trmt10a

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