Gén
MTRR
5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase
- HGNC 7473↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000124275↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 4552↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 5p15.31
- Koordináták
- 5. kromoszóma: 7 869 148–7 901 113 (GRCh38)
- Exonok
- 15 exon, összesen 32 kb
- Fehérje
- 698 aminosav
- Más néven ismert
- cblE
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000440940.7NM_002454.3
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mtrr.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a MTRR-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Homocystinuria & Cobalamin Disorders
- HomocystinuriaAutoszomális recesszív
Includes classic homocystinuria due to CBS deficiency, severe MTHFR deficiency and the combined and remethylation cobalamin disorders, which can cause lens dislocation, blood clots, skeletal changes, anaemia and developmental problems.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing allows treatment with vitamin B6, B12, folate, betaine and diet as appropriate, which can prevent lens dislocation, thrombosis and other complications.
- Inborn Disorders of Cobalamin Metabolism and TransportAutoszomális recesszív
Includes defects in vitamin B12 absorption and transport such as Imerslund-Gräsbeck syndrome (CUBN, AMN), intrinsic factor deficiency (CBLIF) and transcobalamin II deficiency (TCN2), as well as intracellular cobalamin processing defects, which can cause megaloblastic anaemia, nerve damage and failure to thrive.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing allows lifelong vitamin B12 injections or other cobalamin treatment, which can prevent anaemia and neurological damage.
A MTRR felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 32 kb-jából 3,2 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2097 bázis kódolja a fehérjét.
MTRR szekvenálása
2Alacsony
Mennyire nehéz a MTRR szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-bólMinden oszlop azt mutatja, hogy MTRR exonjainak bázisai közül mekkora rész esik az adott típusú nehezen vizsgálható régióba. A pontszám ezeket az egyes régiók rövid olvasatú vizsgálatra gyakorolt hatása szerint súlyozza: 0, ha egyetlen bázis sem esik egyikbe sem, 100, ha minden bázis mindegyikbe beletartozik.
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így ott a hívás hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 35%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 30%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket esetleg nem fednek le. Súly: 15%.2,3%
- GC-tartalom25%-nál kevesebb vagy 65%-nál több G és C bázist tartalmazó ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 10%.13%
- Referencia-lefedettségHiányosságok a közeli referenciaszekvenciában, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez a rövid olvasatokat illeszteni lehetne. Súly: 10%.0%
145
a MTRR génben olyan pozíció, ahol a ClinVar a változást patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősíti
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen találnak meg.
A teljes genom a MTRR gén mind a 32 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az 3,2 kb-nyi exont.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ABCD4ATP binding cassette subfamily D member 42 betegséget oszt meg
- HCFC1host cell factor C12 betegséget oszt meg
- LMBRD1LMBR1 domain containing 12 betegséget oszt meg
- MMACHCmetabolism of cobalamin associated C2 betegséget oszt meg
- MMADHCmetabolism of cobalamin associated D2 betegséget oszt meg
- MTR5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase2 betegséget oszt meg
- PRDX1peroxiredoxin 12 betegséget oszt meg
- AMNamnion associated transmembrane protein1 betegséget oszt meg
- CBLIFcobalamin binding intrinsic factor1 betegséget oszt meg
- CBScystathionine beta-synthase1 betegséget oszt meg
- CD320CD320 molecule1 betegséget oszt meg
- CUBNcubilin1 betegséget oszt meg
A(z) MTRR génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) MTRR gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormal speech pattern
- Abnormality of movement
- Brain degeneration
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Drowsiness
- Epilepsy
Még 16 tulajdonság megjelenítése
- Hyperactive movements
- Intellectual disability
- Loss of consciousness
- Severe global developmental delay
- Behavioral abnormality
- Delayed myelination
- Excessive daytime sleepiness
- Lethargy
- Peripheral neuropathy
- Small brainstem
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Ventriculomegaly
- Widened subarachnoid space
- Abnormal gait
- Degeneration of cerebrum
- Spinal dysraphism
Abnormality of blood and blood-forming tissues
- Megaloblastic anemia
- Normocytic anemia
- Megaloblastic bone marrow
- Increased mean corpuscular volume
- Macrocytic anemia
- Blood clot in a deep vein
- Low blood cell count
- Low blood neutrophil count
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-17 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.17-8666dff2.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). MTRR gén: 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase. Lekérve: 2026. október 18., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/mtrr
Dante Labs. MTRR gén: 5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase reductase [Internet]. [idézve: 2026. október 18.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/mtrr
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt