Gén
MCOLN1
mucolipin TRP cation channel 1
- HGNC 13356↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000090674↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 57192↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 19p13.2
- Koordináták
- 19. kromoszóma: 7 522 624–7 534 009 (GRCh38)
- Exonok
- 14 exon, összesen 11,4 kb
- Fehérje
- 580 aminosav
- Más néven ismert
- TRPML1, ML4, MLIV, MST080, MSTP080, TRPM-L1
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000264079.11NM_020533.3
- Lokusz típusa
- Protein-coding
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mcoln1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a MCOLN1-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Hereditary Corneal Dystrophies
- Corneal Dystrophy
A group of inherited conditions affecting one or more layers of the cornea, including Fuchs endothelial dystrophy (often linked to a TCF4 repeat expansion), TGFBI-related granular and lattice dystrophies, and rarer types caused by genes such as SLC4A11, COL8A2, ZEB1 and CHST6.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Carriers of TGFBI variants are generally advised to avoid laser refractive surgery (LASIK or PRK), which can make deposits worse; corneal transplant can restore vision in advanced disease.
Mucolipidoses (ML II, ML III and ML IV)
- Mucolipidosis type IVAutoszomális recesszív
Developmental delay, progressive vision loss from corneal clouding and retinal degeneration, and low stomach acid, caused by MCOLN1 variants; more common in people of Ashkenazi Jewish ancestry.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 8 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Lysosomal Storage Disease
- Lysosomal storage disease (other and unspecified types)
A 59 hozzá kapcsolódó gén egyike
Covers lysosomal storage diseases without a dedicated report, such as Farber disease and other ASAH1-related disorders, prosaposin (PSAP) deficiencies, multiple sulfatase deficiency, mucopolysaccharidosis types IX and X, and Dorfman-Chanarin disease; inheritance varies by subtype, most often autosomal recessive.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 8 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A MCOLN1 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 11,4 kb-jából 2,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1743 bázis kódolja a fehérjét.
MCOLN1 szekvenálása
132
MCOLN1-pozíció, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem olyan régióba esik, ahol a rövid szekvenciaolvasatok nehezen találnak.
A teljes genomszekvenálás a MCOLN1 gén mind a 11,4 kb-nyi szakaszát lefedi, az intronokat is beleértve, nem csupán az exonok 2,1 kb-át.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferase1 betegséget oszt meg
- AGAaspartylglucosaminidase1 betegséget oszt meg
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 11 betegséget oszt meg
- ARSAarylsulfatase A1 betegséget oszt meg
- ARSBarylsulfatase B1 betegséget oszt meg
- ARSKarylsulfatase family member K1 betegséget oszt meg
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 11 betegséget oszt meg
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 61 betegséget oszt meg
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 61 betegséget oszt meg
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, battenin1 betegséget oszt meg
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthase1 betegséget oszt meg
- CLN6CLN6 transmembrane ER protein1 betegséget oszt meg
A(z) MCOLN1 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) MCOLN1 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). MCOLN1 gén: mucolipin TRP cation channel 1. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/mcoln1
Dante Labs. MCOLN1 gén: mucolipin TRP cation channel 1 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/mcoln1
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt