Gen
MCOLN1
mucolipin TRP cation channel 1
- HGNC 13356↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000090674↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 57192↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 19p13.2
- Koordinater
- Kromosom 19: 7 522 624–7 534 009 (GRCh38)
- Exoner
- 14 exoner på 11,4 kb
- Protein
- 580 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- TRPML1, ML4, MLIV, MST080, MSTP080, TRPM-L1
- MANE Select-transkript
- ENST00000264079.11NM_020533.3
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs MCOLN1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ärftliga hornhinnedystrofier
- Hornhinnedystrofi
En grupp ärftliga tillstånd som påverkar ett eller flera lager i hornhinnan, bland dem Fuchs endoteldystrofi (ofta kopplad till en expansion av en repetition i TCF4), TGFBI-relaterade granulär- och gittrig dystrofi samt ovanligare typer orsakade av gener som SLC4A11, COL8A2, ZEB1 och CHST6.
- 1 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Bärare av TGFBI-varianter rekommenderas i allmänhet att undvika lasерbaserad refraktiv kirurgi (LASIK eller PRK), eftersom den kan förvärra avlagringarna. Hornhinnetransplantation kan återställa synen vid avancerad sjukdom.
Mukolipidoser (ML II, ML III och ML IV)
- Mukolipidos typ IVAutosomalt recessiv
Utvecklingsförsening, progressiv synnedsättning på grund av grumlig hornhinna och retinal degeneration samt låg magsyra, orsakade av varianter i MCOLN1; vanligare hos personer med ashkenazisk judisk bakgrund.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 8 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Bredare grupperingar
Lysosomal lagringssjukdom
- Lysosomal lagringssjukdom (andra och ospecificerade typer)
En av 59 gener kopplade till den
Omfattar lysosomala lagringssjukdomar utan egen rapport, till exempel Farbers sjukdom och andra ASAH1-relaterade sjukdomar, brist på prosaposin (PSAP), multipel sulfatasbrist, mukopolysackaridos typ IX och X samt Dorfman-Chanarins sjukdom; nedärvningen varierar mellan undertyperna, oftast autosomalt recessiv.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 8 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är MCOLN1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 2,1 kb av genens 11,4 kb, och 1 743 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest MCOLN1
132
positioner i MCOLN1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 11,4 kb av MCOLN1, med introner inräknade, inte bara de 2,1 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseDelar 1 tillstånd
- AGAaspartylglucosaminidaseDelar 1 tillstånd
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Delar 1 tillstånd
- ARSAarylsulfatase ADelar 1 tillstånd
- ARSBarylsulfatase BDelar 1 tillstånd
- ARSKarylsulfatase family member KDelar 1 tillstånd
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Delar 1 tillstånd
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Delar 1 tillstånd
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Delar 1 tillstånd
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninDelar 1 tillstånd
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseDelar 1 tillstånd
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till MCOLN1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som MCOLN1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). MCOLN1-genen: mucolipin TRP cation channel 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/mcoln1
Dante Labs. MCOLN1-genen: mucolipin TRP cation channel 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/mcoln1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor