Gene
MCOLN1
mucolipin TRP cation channel 1
- HGNC 13356↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000090674↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 57192↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 19p13.2
- Coordinate
- Cromosoma 19: 7.522.624–7.534.009 (GRCh38)
- Esoni
- 14 esoni su 11,4 kb
- Proteina
- 580 amminoacidi
- Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Noto anche come
- TRPML1, ML4, MLIV, MST080, MSTP080, TRPM-L1
- Trascritto MANE Select
- ENST00000264079.11NM_020533.3
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Distrofie corneali ereditarie
- Distrofia corneale
Un gruppo di condizioni ereditarie che interessano uno o più strati della cornea, tra cui la distrofia endoteliale di Fuchs (spesso associata a un'espansione di ripetizioni in TCF4), le distrofie granulari e reticolari correlate a TGFBI e tipi più rari causati da geni come SLC4A11, COL8A2, ZEB1 e CHST6.
- 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte
Cosa cambia sapendolo
Alle persone portatrici di varianti in TGFBI si consiglia generalmente di evitare la chirurgia refrattiva laser (LASIK o PRK), che può peggiorare i depositi; il trapianto di cornea può ripristinare la vista nella malattia avanzata.
Mucolipidosi (ML II, ML III e ML IV)
- Mucolipidosi di tipo IVAutosomica recessiva
Ritardo dello sviluppo, perdita progressiva della vista dovuta a opacizzazione corneale e degenerazione retinica, e bassa acidità gastrica, causati da varianti di MCOLN1; più comune in persone di ascendenza ebraica askenazita.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Raggruppamenti più ampi
Malattia da accumulo lisosomiale
- Malattia da accumulo lisosomiale (altri tipi e tipo non specificato)
Uno di 59 geni collegati ad esso
Copre le malattie da accumulo lisosomiale senza un referto dedicato, come la malattia di Farber e altre patologie correlate ad ASAH1, le deficienze di prosaposina (PSAP), la deficienza multipla di solfatasi, le mucopolisaccaridosi di tipo IX e X e la malattia di Dorfman-Chanarin; l'ereditarietà varia a seconda del sottotipo, più spesso autosomica recessiva.
- ClinGen valuta il legame come definitivo
- 8 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Ereditarietà
- Autosomica recessiva
- Occorre una copia modificata da ciascun genitore. Con una sola si è portatori e di solito non si manifesta la condizione; quando entrambi i genitori sono portatori, ogni figlio ha una probabilità su quattro di ereditarne due.
Struttura di MCOLN1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 2,1 kb dei 11,4 kb del gene; 1743 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge MCOLN1
132
posizioni in MCOLN1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 11,4 kb di MCOLN1, introni inclusi, non solo i 2,1 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseCondivide 1 condizione
- AGAaspartylglucosaminidaseCondivide 1 condizione
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Condivide 1 condizione
- ARSAarylsulfatase ACondivide 1 condizione
- ARSBarylsulfatase BCondivide 1 condizione
- ARSKarylsulfatase family member KCondivide 1 condizione
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Condivide 1 condizione
- CHST6carbohydrate sulfotransferase 6Condivide 1 condizione
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Condivide 1 condizione
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninCondivide 1 condizione
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseCondivide 1 condizione
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinCondivide 1 condizione
Tratti collegati a MCOLN1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che MCOLN1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene MCOLN1: mucolipin TRP cation channel 1. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/mcoln1
Dante Labs. Gene MCOLN1: mucolipin TRP cation channel 1 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/mcoln1
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