Gén
ADAMTS13
ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 13
- HGNC 1366↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000160323↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 11093↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 9q34.2
- Koordináták
- 9. kromoszóma: 133 422 367–133 459 386 (GRCh38)
- Exonok
- 29 exon, összesen 37 kb
- Fehérje
- 1371 aminosav
- Más néven ismert
- VWFCP, TTP, vWF-CP, FLJ42993, MGC118899, MGC118900, DKFZp434C2322
- Korábbi jelölések
- C9orf8
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000355699.7NM_139027.6
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/adamts13.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a ADAMTS13-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Congenital Thrombotic Thrombocytopenic Purpura
- Congenital Thrombotic Thrombocytopenic Purpura (Upshaw-Schulman Syndrome)Autoszomális recesszív
Caused by changes in both copies of ADAMTS13; episodes may begin in newborns, often with severe jaundice, or first appear in adulthood, frequently triggered by pregnancy or infection.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Regular preventive treatment with plasma or recombinant ADAMTS13 prevents acute episodes, and close monitoring is needed in pregnancy.
Inherited Thrombocytopenias
- Inherited Thrombocytopenia
A group of conditions causing a lifelong low platelet count, linked to genes such as MYH9, ANKRD26, ETV6, WAS, MPL, RBM8A, GATA1 and MECOM, and inherited in dominant, recessive or X-linked patterns.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 4 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
A genetic diagnosis avoids misdiagnosis as immune thrombocytopenia, with unnecessary steroids or spleen removal, and guides monitoring for related kidney, hearing or blood problems.
A ADAMTS13 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 37 kb-jából 4,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 4116 bázis kódolja a fehérjét.
ADAMTS13 szekvenálása
10Könnyű
Mennyire nehéz a ADAMTS13 rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A ADAMTS13 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ehhez hozzájárul: a ADAMTS13 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.0,8%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.49%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a ADAMTS13 exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
59
a ADAMTS13 azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül egy sem olyan régióban van, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genom a ADAMTS13 mind a 37 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 4,4 kb exont.
ClinVar patogén variánsok (60)
A ClinVar által patogénnek vagy valószínűleg patogénnek minősített ADAMTS13-variánsok bármely betegséggel kapcsolatban, legalább egy, kritériumokat alkalmazó beküldő által felülvizsgálva, valamint ezek közül a legtöbbet felülvizsgált változatok. Ez a gén nyilvános ClinVar-nyilvántartása, nem pedig eredmény.
- Patogén 17
- Patogén/valószínűleg patogén 4
- Valószínűleg patogén 39
| Variáns | Betegségek | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.1169G>A (p.Trp390Ter) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.3975dup (p.Glu1326fs) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.330+1G>A (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.3070T>G (p.Cys1024Gly) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura és 1 további | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.3178C>T (p.Arg1060Trp) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura és 1 további | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.3482T>C (p.Ile1161Thr) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura és 1 további | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.781del (p.Ala261fs) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.1058C>T (p.Pro353Leu) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.1192C>T (p.Arg398Cys) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.1492C>T (p.Arg498Cys) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.85G>T (p.Gly29Ter) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.155del (p.Pro52fs) (új lapon nyílik meg) | thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.587C>T (p.Thr196Ile) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura és 1 további | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.799_808del (p.Arg267fs) (új lapon nyílik meg) | thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.1094G>A (p.Trp365Ter) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.1456_1457del (p.Met486fs) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.1787C>T (p.Ala596Val) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura és 1 további | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.2074C>T (p.Arg692Cys) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.2153T>A (p.Leu718Ter) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.2863dup (p.Trp955fs) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.2883del (p.Cys962fs) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.2920_2938del (p.Ile974fs) (új lapon nyílik meg) | thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.3198_3199del (p.Cys1067fs) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.3242G>A (p.Trp1081Ter) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_139027.6(ADAMTS13):c.3547G>A (p.Gly1183Arg) (új lapon nyílik meg) | congenital thrombotic thrombocytopenic purpura | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
Mind a 60 megtekintése a ClinVar összes többi ADAMTS13-variánsával együtt → (új lapon nyílik meg)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACTBactin beta1 betegséget oszt meg
- ACTN1actinin alpha 11 betegséget oszt meg
- ANKRD26ankyrin repeat domain 261 betegséget oszt meg
- ARPC1Bactin related protein 2/3 complex subunit 1B1 betegséget oszt meg
- CDC42cell division cycle 421 betegséget oszt meg
- CYCScytochrome c, somatic1 betegséget oszt meg
- DIAPH1diaphanous related formin 11 betegséget oszt meg
- ETV6ETS variant transcription factor 61 betegséget oszt meg
- FLI1Fli-1 proto-oncogene, ETS transcription factor1 betegséget oszt meg
- FYB1FYN binding protein 11 betegséget oszt meg
- GALEUDP-galactose-4-epimerase1 betegséget oszt meg
- GATA1GATA binding protein 11 betegséget oszt meg
A(z) ADAMTS13 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) ADAMTS13 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). ADAMTS13 gén: ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 13. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/adamts13
Dante Labs. ADAMTS13 gén: ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 13 [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/adamts13
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt