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Gène

NDE1

nudE neurodevelopment protein 1

Résumé

Localisation cytogénétique
16p13.11
Coordonnées
Chromosome 16 : 15 650 245–15 726 353 (GRCh38)
Exons
9 exons sur 76,1 kb
Protéine
335 acides aminés
Aussi appelé
nudE, FLJ20101, NDE
Transcrit MANE Select
ENST00000396354.6NM_017668.3
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore NDE1. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de NDE1

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 16, avec un crochet à l'emplacement de NDE1. NDE1 et 9 gènes à proximité sur le chromosome 16, de 15 188 299 à 16 188 298.Chromosome 1616p13.11p13.3p13.2p13.13p13.12p13.11p12.3p12.2p12.1p11.2p11.1q11.1q11.2q12.1q12.2q13q21q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.315,2 Mb15,4 Mb15,6 Mb15,8 Mb16 MbNPIPA5 : 15 363 628–15 381 047, brin inverseNPIPA5MPV17L : 15 395 747–15 413 271, brin directMPV17L : 15 395 754–15 515 348, brin directBMERB1 : 15 434 475–15 625 028, brin directBMERB1MARF1 : 15 594 302–15 643 209, brin inverseMARF1NDE1 : 15 650 245–15 726 353, brin directNDE1MYH11 : 15 703 135–15 858 438, brin inverseMYH11CEP20 : 15 865 719–15 888 644, brin inverseCEP20ABCC1 : 15 949 138–16 143 257, brin directABCC1ABCC6 : 16 149 565–16 223 637, brin inverseABCC6Schéma de NDE1 : 9 exons sur le brin direct du chromosome 16Exon 3 : 2 sites connus associés à une maladieExon 6 : 2 sites connus associés à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 15 650 245–15 650 294, 50 basesExon 2 : 15 664 736–15 664 861, 126 basesExon 3 : 15 667 286–15 667 439, 154 basesExon 4 : 15 677 801–15 677 949, 149 basesExon 5 : 15 687 375–15 687 511, 137 basesExon 6 : 15 691 144–15 691 323, 180 basesExon 7 : 15 694 165–15 694 256, 92 basesExon 8 : 15 696 709–15 696 860, 152 basesExon 9 : 15 724 191–15 726 353, 2 163 bases1234567895′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 3,2 kb sur les 76,1 kb du gène ; 1 008 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit NDE1

7

positions dans NDE1 où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 76,1 kb de NDE1, introns compris, et pas seulement les 3,2 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gène NDE1 : nudE neurodevelopment protein 1. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/nde1

Vancouver

Dante Labs. Gène NDE1 : nudE neurodevelopment protein 1 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/nde1

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