Siirry sisältöön
Käytä HSA- tai FSA-varojasi

Geeni

VCAN

versican

Yhteenveto

Sytogeneettinen sijainti
5q14.2-q14.3
Koordinaatit
Kromosomi 5: 83 471 744–83 582 302 (GRCh38)
Eksonit
15 eksonia 110,6 kb:n alueella
Proteiini
3 396 aminohappoa
Tunnetaan myös nimellä
PG-M
Aiemmat symbolit
CSPG2
MANE Select -transkripti
ENST00000265077.8NM_004385.5
Lokustyyppi
gene with protein product

ViitegenomiGRCh38

Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.

Tähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti

  • Vitreoretinopatia

    • Vitreoretinaalinen degeneraatio
      • ClinGen luokittelee yhteyden: varma
      • 4 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi

VCAN-geenin rakenne

  • Koodaava jakso
  • Translatoimaton alue
  • Intron
  • Transkription suunta
  • Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
  • Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Kromosomi 5, jossa hakasulke osoittaa VCAN-geenin sijainnin. VCAN ja 4 geeniä sen läheisyydessä kromosomissa 5, välillä 83 027 023–84 027 022.Kromosomi 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A: 83 022 799–83 077 863, juoste taaksepäinTMEM167AXRCC4: 83 077 498–83 370 453, juoste eteenpäinXRCC4VCAN: 83 471 744–83 582 302, juoste eteenpäinVCANHAPLN1: 83 637 805–83 723 528, juoste taaksepäinHAPLN1EDIL3: 83 939 098–84 384 891, juoste taaksepäinEDIL3VCAN-kaavio: 15 eksonia kromosomin 5 juosteella, eteenpäinEksoni 6: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 7: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEksoni 8: 1 tunnettu tautia aiheuttava kohtaEkson 1: 83 471 744–83 472 023, 280 emästäEkson 2: 83 483 513–83 483 588, 76 emästäEkson 3: 83 490 098–83 490 472, 375 emästäEkson 4: 83 493 546–83 493 720, 175 emästäEkson 5: 83 493 804–83 493 931, 128 emästäEkson 6: 83 512 103–83 512 396, 294 emästäEkson 7: 83 519 349–83 522 309, 2 961 emästäEkson 8: 83 537 007–83 542 268, 5 262 emästäEkson 9: 83 545 537–83 545 650, 114 emästäEkson 10: 83 547 971–83 548 084, 114 emästäEkson 11: 83 553 364–83 553 522, 159 emästäEkson 12: 83 554 956–83 555 038, 83 emästäEkson 13: 83 572 416–83 572 560, 145 emästäEkson 14: 83 579 980–83 580 162, 183 emästäEkson 15: 83 580 307–83 582 302, 1 996 emästä1510155′3′

Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.

Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).

Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.

Eksonit muodostavat 12,3 kb geenin 110,6 kb:stä; 10 191 näistä emäksistä koodaa proteiinia.

Miten genomitesti lukee geeniä VCAN

6

VCAN-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi

Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.

Kokogenomi kattaa kaikki 110,6 kb geenistä VCAN, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 12,3 kb eksoneja.

Mistä tieto on peräisin

  • HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
  • MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
  • GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
  • ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
  • ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
  • Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
  • Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.

Viittaa tähän sivuun

APA

Dante Labs. (n.d.). VCAN-geeni: versican. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. VCAN-geeni: versican [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/vcan

Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.

Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa

Tilaa Genome Test