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Gene

VCAN

versican

Sintesi

Localizzazione citogenetica
5q14.2-q14.3
Coordinate
Cromosoma 5: 83.471.744–83.582.302 (GRCh38)
Esoni
15 esoni su 110,6 kb
Proteina
3396 amminoacidi
Noto anche come
PG-M
Simboli precedenti
CSPG2
Trascritto MANE Select
ENST00000265077.8NM_004385.5
Tipo di locus
gene with protein product

Genoma di riferimentoGRCh38

Le posizioni nelle pagine di geni e varianti seguono questa scelta, in questo browser.

Report curato rilevante per questo gene

  • Vitreoretinopatia

    • Degenerazione vitreoretinica
      • ClinGen valuta il legame come definitivo
      • 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte

Struttura di VCAN

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma 5, con una parentesi dove si trova VCAN. VCAN e 4 geni nelle vicinanze sul cromosoma 5, da 83.027.023 a 84.027.022.Cromosoma 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A: 83.022.799–83.077.863, filamento inversoTMEM167AXRCC4: 83.077.498–83.370.453, filamento direttoXRCC4VCAN: 83.471.744–83.582.302, filamento direttoVCANHAPLN1: 83.637.805–83.723.528, filamento inversoHAPLN1EDIL3: 83.939.098–84.384.891, filamento inversoEDIL3Diagramma di VCAN: 15 esoni sul filamento diretto del cromosoma 5Esone 6: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 7: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 8: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 83.471.744–83.472.023, 280 basiEsone 2: 83.483.513–83.483.588, 76 basiEsone 3: 83.490.098–83.490.472, 375 basiEsone 4: 83.493.546–83.493.720, 175 basiEsone 5: 83.493.804–83.493.931, 128 basiEsone 6: 83.512.103–83.512.396, 294 basiEsone 7: 83.519.349–83.522.309, 2961 basiEsone 8: 83.537.007–83.542.268, 5262 basiEsone 9: 83.545.537–83.545.650, 114 basiEsone 10: 83.547.971–83.548.084, 114 basiEsone 11: 83.553.364–83.553.522, 159 basiEsone 12: 83.554.956–83.555.038, 83 basiEsone 13: 83.572.416–83.572.560, 145 basiEsone 14: 83.579.980–83.580.162, 183 basiEsone 15: 83.580.307–83.582.302, 1996 basi1510155′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 12,3 kb dei 110,6 kb del gene; 10.191 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge VCAN

6

posizioni in VCAN in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 110,6 kb di VCAN, introni inclusi, non solo i 12,3 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
  • La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene VCAN: versican. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. Gene VCAN: versican [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/vcan

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