Hopp til innhold
Bruk midlene fra HSA eller FSA

Gen

VCAN

versican

Sammendrag

Cytogenetisk plassering
5q14.2-q14.3
Koordinater
Kromosom 5: 83 471 744–83 582 302 (GRCh38)
Eksoner
15 eksoner over 110,6 kb
Protein
3 396 aminosyrer
Også kjent som
PG-M
Tidligere symboler
CSPG2
MANE Select-transkripsjon
ENST00000265077.8NM_004385.5
Lokustype
gene with protein product

ReferansegenomGRCh38

Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.

Kuratert rapport som er relevant for dette genet

  • Vitreoretinopati

    • Vitreoretinal degenerasjon
      • ClinGen vurderer koblingen som definitiv
      • 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk

Slik er VCAN bygget opp

  • Kodende sekvens
  • Utranslatert region
  • Intron
  • Transkripsjonsretning
  • Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
  • Områder som korte avlesninger sliter med
Kromosom 5, med en parentes der VCAN står. VCAN og 4 gener i nærheten på kromosom 5, fra 83 027 023 til 84 027 022.Kromosom 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A: 83 022 799–83 077 863, bakover-strengTMEM167AXRCC4: 83 077 498–83 370 453, fremover-strengXRCC4VCAN: 83 471 744–83 582 302, fremover-strengVCANHAPLN1: 83 637 805–83 723 528, bakover-strengHAPLN1EDIL3: 83 939 098–84 384 891, bakover-strengEDIL3Diagram av VCAN: 15 eksoner på fremover-strengen til kromosom 5Ekson 6: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 7: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 8: 1 kjent sykdomsfremkallende posisjonEkson 1: 83 471 744–83 472 023, 280 baserEkson 2: 83 483 513–83 483 588, 76 baserEkson 3: 83 490 098–83 490 472, 375 baserEkson 4: 83 493 546–83 493 720, 175 baserEkson 5: 83 493 804–83 493 931, 128 baserEkson 6: 83 512 103–83 512 396, 294 baserEkson 7: 83 519 349–83 522 309, 2 961 baserEkson 8: 83 537 007–83 542 268, 5 262 baserEkson 9: 83 545 537–83 545 650, 114 baserEkson 10: 83 547 971–83 548 084, 114 baserEkson 11: 83 553 364–83 553 522, 159 baserEkson 12: 83 554 956–83 555 038, 83 baserEkson 13: 83 572 416–83 572 560, 145 baserEkson 14: 83 579 980–83 580 162, 183 baserEkson 15: 83 580 307–83 582 302, 1 996 baser1510155′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.

Eksonene utgjør 12,3 kb av genets 110,6 kb, og 10 191 av disse basene koder for proteinet.

Slik leser en genetisk test VCAN

6

posisjoner i VCAN der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen

Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.

En helgenomsekvensering dekker alle 110,6 kb av VCAN, inkludert introner, og ikke bare de 12,3 kb med eksoner.

Hvor dette kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
  • GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
  • ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
  • ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
  • The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
  • Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.

Siter denne siden

APA

Dante Labs. (u.d.). VCAN-genet: versican. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. VCAN-genet: versican [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/vcan

Én test. En livstid med svar.

Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker

Få mitt Genome Test