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Gène

VCAN

versican

Résumé

Localisation cytogénétique
5q14.2-q14.3
Coordonnées
Chromosome 5 : 83 471 744–83 582 302 (GRCh38)
Exons
15 exons sur 110,6 kb
Protéine
3 396 acides aminés
Aussi appelé
PG-M
Symboles précédents
CSPG2
Transcrit MANE Select
ENST00000265077.8NM_004385.5
Type de locus
gene with protein product

Génome de référenceGRCh38

Les positions sur les pages de gènes et de variants suivent ce choix, dans ce navigateur.

Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

  • Vitréorétinopathie

    • Dégénérescence vitréorétinienne
      • ClinGen classe ce lien comme définitif
      • 4 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort

Structure de VCAN

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Sites connus associés à une maladie
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 5, avec un crochet à l'emplacement de VCAN. VCAN et 4 gènes à proximité sur le chromosome 5, de 83 027 023 à 84 027 022.Chromosome 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A : 83 022 799–83 077 863, brin inverseTMEM167AXRCC4 : 83 077 498–83 370 453, brin directXRCC4VCAN : 83 471 744–83 582 302, brin directVCANHAPLN1 : 83 637 805–83 723 528, brin inverseHAPLN1EDIL3 : 83 939 098–84 384 891, brin inverseEDIL3Schéma de VCAN : 15 exons sur le brin direct du chromosome 5Exon 6 : 1 site connu associé à une maladieExon 7 : 1 site connu associé à une maladieExon 8 : 1 site connu associé à une maladieExon 1 : 83 471 744–83 472 023, 280 basesExon 2 : 83 483 513–83 483 588, 76 basesExon 3 : 83 490 098–83 490 472, 375 basesExon 4 : 83 493 546–83 493 720, 175 basesExon 5 : 83 493 804–83 493 931, 128 basesExon 6 : 83 512 103–83 512 396, 294 basesExon 7 : 83 519 349–83 522 309, 2 961 basesExon 8 : 83 537 007–83 542 268, 5 262 basesExon 9 : 83 545 537–83 545 650, 114 basesExon 10 : 83 547 971–83 548 084, 114 basesExon 11 : 83 553 364–83 553 522, 159 basesExon 12 : 83 554 956–83 555 038, 83 basesExon 13 : 83 572 416–83 572 560, 145 basesExon 14 : 83 579 980–83 580 162, 183 basesExon 15 : 83 580 307–83 582 302, 1 996 bases1510155′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 12,3 kb sur les 110,6 kb du gène ; 10 191 de ces bases codent pour la protéine.

Comment un test génomique lit VCAN

6

positions dans VCAN où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène

Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.

Un génome entier couvre les 110,6 kb de VCAN, introns compris, et pas seulement les 12,3 kb d'exons.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
  • GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
  • La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
  • ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
  • L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
  • Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène VCAN : versican. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. Gène VCAN : versican [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/vcan

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