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Gen

VCAN

versican

Resumen

Localización citogenética
5q14.2-q14.3
Coordenadas
Cromosoma 5: 83.471.744–83.582.302 (GRCh38)
Exones
15 exones en 110,6 kb
Proteína
3396 aminoácidos
También conocido como
PG-M
Símbolos anteriores
CSPG2
Transcrito MANE Select
ENST00000265077.8NM_004385.5
Tipo de locus
gene with protein product

Genoma de referenciaGRCh38

Las posiciones en las páginas de genes y variantes siguen esta elección, en este navegador.

Informe revisado relevante para este gen

  • Vitrorretinopatía

    • Degeneración vitrorretiniana
      • ClinGen califica la relación como definitiva
      • 4 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte

Estructura de VCAN

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Sitios conocidos que causan enfermedad
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma 5, con un corchete donde se ubica VCAN. VCAN y 4 genes cercanos en el cromosoma 5, desde 83.027.023 hasta 84.027.022.Cromosoma 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A: 83.022.799–83.077.863, hebra inversaTMEM167AXRCC4: 83.077.498–83.370.453, hebra directaXRCC4VCAN: 83.471.744–83.582.302, hebra directaVCANHAPLN1: 83.637.805–83.723.528, hebra inversaHAPLN1EDIL3: 83.939.098–84.384.891, hebra inversaEDIL3Diagrama de VCAN: 15 exones en la hebra directa del cromosoma 5Exón 6: 1 sitio conocido que causa enfermedadExón 7: 1 sitio conocido que causa enfermedadExón 8: 1 sitio conocido que causa enfermedadExón 1: 83.471.744–83.472.023, 280 basesExón 2: 83.483.513–83.483.588, 76 basesExón 3: 83.490.098–83.490.472, 375 basesExón 4: 83.493.546–83.493.720, 175 basesExón 5: 83.493.804–83.493.931, 128 basesExón 6: 83.512.103–83.512.396, 294 basesExón 7: 83.519.349–83.522.309, 2961 basesExón 8: 83.537.007–83.542.268, 5262 basesExón 9: 83.545.537–83.545.650, 114 basesExón 10: 83.547.971–83.548.084, 114 basesExón 11: 83.553.364–83.553.522, 159 basesExón 12: 83.554.956–83.555.038, 83 basesExón 13: 83.572.416–83.572.560, 145 basesExón 14: 83.579.980–83.580.162, 183 basesExón 15: 83.580.307–83.582.302, 1996 bases1510155′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 12,3 kb de los 110,6 kb del gen; 10.191 de esas bases codifican la proteína.

Cómo lee una prueba genómica el gen VCAN

6

posiciones en VCAN donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico

Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.

Un genoma completo cubre los 110,6 kb de VCAN, incluidos los intrones, y no solo los 12,3 kb de exones.

Origen de estos datos

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
  • La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
  • ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
  • Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
  • Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen VCAN: versican. Consultado el 16 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. Gen VCAN: versican [Internet]. [citado 16 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/vcan

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