Hoppa till innehållet
Använd dina HSA- eller FSA-medel

Gen

VCAN

versican

Sammanfattning

Cytogenetisk position
5q14.2-q14.3
Koordinater
Kromosom 5: 83 471 744–83 582 302 (GRCh38)
Exoner
15 exoner på 110,6 kb
Protein
3 396 aminosyror
Även känd som
PG-M
Tidigare symboler
CSPG2
MANE Select-transkript
ENST00000265077.8NM_004385.5
Lokustyp
gene with protein product

ReferensgenomGRCh38

Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.

Kuraterad rapport som är relevant för denna gen

  • Vitreoretinopati

    • Vitreoretinal degeneration
      • ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
      • 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark

Så är VCAN uppbyggd

  • Kodande sekvens
  • Otranslaterad region
  • Intron
  • Transkriptionsriktning
  • Kända sjukdomsorsakande ställen
  • Sträckor som korta läsningar har svårt för
Kromosom 5, med en parentes där VCAN finns. VCAN och 4 gener i närheten på kromosom 5, från 83 027 023 till 84 027 022.Kromosom 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A: 83 022 799–83 077 863, bakåt-strängTMEM167AXRCC4: 83 077 498–83 370 453, framåt-strängXRCC4VCAN: 83 471 744–83 582 302, framåt-strängVCANHAPLN1: 83 637 805–83 723 528, bakåt-strängHAPLN1EDIL3: 83 939 098–84 384 891, bakåt-strängEDIL3Diagram över VCAN: 15 exoner på framåt-strängen av kromosom 5Exon 6: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 7: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 8: 1 känt sjukdomsorsakande ställeExon 1: 83 471 744–83 472 023, 280 baserExon 2: 83 483 513–83 483 588, 76 baserExon 3: 83 490 098–83 490 472, 375 baserExon 4: 83 493 546–83 493 720, 175 baserExon 5: 83 493 804–83 493 931, 128 baserExon 6: 83 512 103–83 512 396, 294 baserExon 7: 83 519 349–83 522 309, 2 961 baserExon 8: 83 537 007–83 542 268, 5 262 baserExon 9: 83 545 537–83 545 650, 114 baserExon 10: 83 547 971–83 548 084, 114 baserExon 11: 83 553 364–83 553 522, 159 baserExon 12: 83 554 956–83 555 038, 83 baserExon 13: 83 572 416–83 572 560, 145 baserExon 14: 83 579 980–83 580 162, 183 baserExon 15: 83 580 307–83 582 302, 1 996 baser1510155′3′

Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.

Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.

Exoner utgör 12,3 kb av genens 110,6 kb, och 10 191 av dessa baser kodar för proteinet.

Så läser ett genomtest VCAN

6

positioner i VCAN där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen

Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.

En helgenomsanalys täcker alla 110,6 kb av VCAN, med introner inräknade, inte bara de 12,3 kb exoner.

Varifrån detta kommer

  • HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
  • MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
  • GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
  • ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
  • ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
  • Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.

Citera den här sidan

APA

Dante Labs. (u.å.). VCAN-genen: versican. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. VCAN-genen: versican [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/vcan

Ett test. Ett helt liv av svar.

Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor

Beställ mitt Genome Test