Přejít na obsah
Použijte své prostředky HSA nebo FSA

Gen

VCAN

versican

Shrnutí

Cytogenetická poloha
5q14.2-q14.3
Souřadnice
Chromozom 5: 83 471 744–83 582 302 (GRCh38)
Exony
15 exonů na 110,6 kb
Protein
3 396 aminokyselin
Další názvy
PG-M
Předchozí symboly
CSPG2
Transkript MANE Select
ENST00000265077.8NM_004385.5
Typ lokusu
gene with protein product

Referenční genomGRCh38

Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.

Kurátorovaný report související s tímto genem

  • Vitreoretinopathy

    • Vitreoretinal Degeneration
      • Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
      • 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou

Jak je VCAN uspořádán

  • Kódující sekvence
  • Netranslatovaná oblast
  • Intron
  • Směr transkripce
  • Známá místa způsobující onemocnění
  • Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Chromozom 5, se závorkou u VCAN. VCAN a 4 genů poblíž na chromozomu 5, od 83 027 023 do 84 027 022.Chromozom 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A: 83 022 799–83 077 863, řetězec zpětnémTMEM167AXRCC4: 83 077 498–83 370 453, řetězec dopřednémXRCC4VCAN: 83 471 744–83 582 302, řetězec dopřednémVCANHAPLN1: 83 637 805–83 723 528, řetězec zpětnémHAPLN1EDIL3: 83 939 098–84 384 891, řetězec zpětnémEDIL3Schéma VCAN: 15 exonů na dopředném řetězci chromozomu 5Exon 6: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 7: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 8: 1 známé místo způsobující onemocněníExon 1: 83 471 744–83 472 023, 280 bázíExon 2: 83 483 513–83 483 588, 76 bázíExon 3: 83 490 098–83 490 472, 375 bázíExon 4: 83 493 546–83 493 720, 175 bázíExon 5: 83 493 804–83 493 931, 128 bázíExon 6: 83 512 103–83 512 396, 294 bázíExon 7: 83 519 349–83 522 309, 2 961 bázíExon 8: 83 537 007–83 542 268, 5 262 bázíExon 9: 83 545 537–83 545 650, 114 bázíExon 10: 83 547 971–83 548 084, 114 bázíExon 11: 83 553 364–83 553 522, 159 bázíExon 12: 83 554 956–83 555 038, 83 bázíExon 13: 83 572 416–83 572 560, 145 bázíExon 14: 83 579 980–83 580 162, 183 bázíExon 15: 83 580 307–83 582 302, 1 996 bází1510155′3′

Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.

Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.

Exony tvoří 12,3 kb z 110,6 kb genu; 10 191 těchto bází kódují protein.

Jak genetický test čte VCAN

6

pozic v genu VCAN, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní

Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.

Celý genom pokrývá všech 110,6 kb genu VCAN, včetně intronů, nikoli jen 12,3 kb exonů.

Odkud údaje pocházejí

  • HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
  • MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
  • GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
  • Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
  • ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
  • Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
  • Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.

Citovat tuto stránku

APA

Dante Labs. (b.d.). Gen VCAN: versican. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. Gen VCAN: versican [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/vcan

Jeden test. Odpovědi na celý život.

Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů

Objednejte si Genome Test