Gå til indhold
Brug dine HSA- eller FSA-midler

Gen

VCAN

versican

Oversigt

Cytogenetisk placering
5q14.2-q14.3
Koordinater
Kromosom 5: 83.471.744–83.582.302 (GRCh38)
Exoner
15 exoner fordelt over 110,6 kb
Protein
3.396 aminosyrer
Også kendt som
PG-M
Tidligere symboler
CSPG2
MANE Select-transkript
ENST00000265077.8NM_004385.5
Lokustype
gene with protein product

ReferencegenomGRCh38

Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.

Kurateret rapport relevant for dette gen

  • Vitreoretinopati

    • Vitreoretinal degeneration
      • ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
      • 4 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk

Sådan er VCAN opbygget

  • Kodende sekvens
  • Utranslateret region
  • Intron
  • Transkriptionsretning
  • Kendte sygdomsfremkaldende steder
  • Regioner, som korte læsninger har svært ved
Kromosom 5, med en klamme ved VCAN. VCAN og 4 gener i nærheden på kromosom 5, fra 83.027.023 til 84.027.022.Kromosom 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A: 83.022.799–83.077.863, omvendt-strengTMEM167AXRCC4: 83.077.498–83.370.453, fremadrettet-strengXRCC4VCAN: 83.471.744–83.582.302, fremadrettet-strengVCANHAPLN1: 83.637.805–83.723.528, omvendt-strengHAPLN1EDIL3: 83.939.098–84.384.891, omvendt-strengEDIL3Diagram af VCAN: 15 exoner på fremadrettet-strengen af kromosom 5Exon 6: 1 kendt sygdomsfremkaldende stedExon 7: 1 kendt sygdomsfremkaldende stedExon 8: 1 kendt sygdomsfremkaldende stedExon 1: 83.471.744–83.472.023, 280 baserExon 2: 83.483.513–83.483.588, 76 baserExon 3: 83.490.098–83.490.472, 375 baserExon 4: 83.493.546–83.493.720, 175 baserExon 5: 83.493.804–83.493.931, 128 baserExon 6: 83.512.103–83.512.396, 294 baserExon 7: 83.519.349–83.522.309, 2.961 baserExon 8: 83.537.007–83.542.268, 5.262 baserExon 9: 83.545.537–83.545.650, 114 baserExon 10: 83.547.971–83.548.084, 114 baserExon 11: 83.553.364–83.553.522, 159 baserExon 12: 83.554.956–83.555.038, 83 baserExon 13: 83.572.416–83.572.560, 145 baserExon 14: 83.579.980–83.580.162, 183 baserExon 15: 83.580.307–83.582.302, 1.996 baser1510155′3′

Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.

Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).

Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.

Eksoner udgør 12,3 kb af genets 110,6 kb; 10.191 af disse baser koder for proteinet.

Sådan læser en genomtest VCAN

6

positioner i VCAN, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen

Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.

En helgenomsanalyse dækker alle 110,6 kb af VCAN, inklusive introner, og ikke kun de 12,3 kb eksoner.

Hvor oplysningerne kommer fra

  • HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
  • MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
  • GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
  • ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
  • ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
  • Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
  • Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.

Citér denne side

APA

Dante Labs. (u.d.). VCAN-genet: versican. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. VCAN-genet: versican [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/vcan

Én test. Svar for hele livet.

Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger

Bestil min Genome Test