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Gene

VCAN

versican

Resumo

Localização citogenética
5q14.2-q14.3
Coordenadas
Cromossoma 5: 83 471 744–83 582 302 (GRCh38)
Exões
15 exões ao longo de 110,6 kb
Proteína
3396 aminoácidos
Também conhecido como
PG-M
Símbolos anteriores
CSPG2
Transcrito MANE Select
ENST00000265077.8NM_004385.5
Tipo de locus
gene with protein product

Genoma de referênciaGRCh38

As posições nas páginas de genes e variantes seguem esta escolha, neste navegador.

Relatório com curadoria relevante para este gene

  • Vitreorretinopatia

    • Degeneração Vitreorretiniana
      • A ClinGen classifica a associação como definitiva
      • 4 submissores GenCC classificam-na como definitiva ou forte

Como VCAN está organizado

  • Sequência codificante
  • Região não traduzida
  • Intrão
  • Sentido da transcrição
  • Locais conhecidos associados a doença
  • Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Cromossoma 5, com um parêntese onde se situa VCAN. VCAN e 4 genes próximos no cromossoma 5, de 83 027 023 a 84 027 022.Cromossoma 55q14.2-q14.3p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14.3p14.2p14.1p13.3p13.2p13.1p12p11q11.1q11.2q12.1q12.2q12.3q13.1q13.2q13.3q14.1q14.2q14.3q15q21.1q21.2q21.3q22.1q22.2q22.3q23.1q23.2q23.3q31.1q31.2q31.3q32q33.1q33.2q33.3q34q35.1q35.2q35.383,2 Mb83,4 Mb83,6 Mb83,8 Mb84 MbTMEM167A: 83 022 799–83 077 863, fita inversaTMEM167AXRCC4: 83 077 498–83 370 453, fita diretaXRCC4VCAN: 83 471 744–83 582 302, fita diretaVCANHAPLN1: 83 637 805–83 723 528, fita inversaHAPLN1EDIL3: 83 939 098–84 384 891, fita inversaEDIL3Diagrama de VCAN: 15 exões na cadeia direta do cromossoma 5Exão 6: 1 local conhecido associado a doençaExão 7: 1 local conhecido associado a doençaExão 8: 1 local conhecido associado a doençaExão 1: 83 471 744–83 472 023, 280 basesExão 2: 83 483 513–83 483 588, 76 basesExão 3: 83 490 098–83 490 472, 375 basesExão 4: 83 493 546–83 493 720, 175 basesExão 5: 83 493 804–83 493 931, 128 basesExão 6: 83 512 103–83 512 396, 294 basesExão 7: 83 519 349–83 522 309, 2961 basesExão 8: 83 537 007–83 542 268, 5262 basesExão 9: 83 545 537–83 545 650, 114 basesExão 10: 83 547 971–83 548 084, 114 basesExão 11: 83 553 364–83 553 522, 159 basesExão 12: 83 554 956–83 555 038, 83 basesExão 13: 83 572 416–83 572 560, 145 basesExão 14: 83 579 980–83 580 162, 183 basesExão 15: 83 580 307–83 582 302, 1996 bases1510155′3′

Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.

Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).

Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.

Os exões representam 12,3 kb dos 110,6 kb do gene; 10 191 dessas bases codificam a proteína.

Como um teste de genoma lê VCAN

6

posições em VCAN onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica

Nenhuma delas se situa numa região onde as leituras curtas têm dificuldade.

Um genoma completo abrange todos os 110,6 kb de VCAN, incluindo os intrões, e não apenas os 12,3 kb de exões.

De onde vem esta informação

  • HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
  • MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
  • GenCC e ClinGen, publicado em 2026-10-16: as condições a que o gene está associado e o grau dessa associação.
  • A lista ACMG de achados secundários, SF v3.2.
  • ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos associados a doenças e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
  • Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
  • Versão dos dados 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s.d.). Gene VCAN: versican. Consultado em 16 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/vcan

Vancouver

Dante Labs. Gene VCAN: versican [Internet]. [consultado em 16 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/vcan

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