Geeni
RS1
retinoschisin 1
- HGNC 10457↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000102104↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6247↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- Xp22.13
- Koordinaatit
- Kromosomi X: 18 639 688–18 672 108 (GRCh38)
- Eksonit
- 6 eksonia 32,4 kb:n alueella
- Proteiini
- 224 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- XLRS1
- Aiemmat symbolit
- RS
- MANE Select -transkripti
- ENST00000379984.4NM_000330.4
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue RS1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Vitreoretinopatia
- Vitreoretinaalinen degeneraatio
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 6 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
RS1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3 kb geenin 32,4 kb:stä; 675 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä RS1
149
RS1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 32,4 kb geenistä RS1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 3 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (108)
Tässä ovat RS1-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A18T | c.52G>A | Eksoni 1 | 18 672 017 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| c.1A>T | Eksoni 1 | 18 672 068 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.52+1G>A | Introni 1 | 18 672 016 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.52+1G>C | Introni 1 | 18 672 016 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.52+1G>T | Introni 1 | 18 672 016 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.52+2T>A | Introni 1 | 18 672 015 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.52+2T>C | Introni 1 | 18 672 015 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.53-1G>A | Introni 1 | 18 657 666 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.53-713_78+266del | Introni 2 | 18 657 373 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.78+1G>A | Introni 2 | 18 657 639 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- BEST1bestrophin 1Yhteinen sairaus: 1
- CAPN5calpain 5Yhteinen sairaus: 1
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL18A1collagen type XVIII alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainYhteinen sairaus: 1
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainYhteinen sairaus: 1
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainYhteinen sairaus: 1
- CTNNB1catenin beta 1Yhteinen sairaus: 1
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Yhteinen sairaus: 1
- FZD4frizzled class receptor 4Yhteinen sairaus: 1
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Yhteinen sairaus: 1
Geeniin RS1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita RS1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). RS1-geeni: retinoschisin 1. Haettu 16. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/rs1
Dante Labs. RS1-geeni: retinoschisin 1 [Internet]. [viitattu 16. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/rs1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa