Geeni
FAN1
FANCD2 and FANCI associated nuclease 1
- HGNC 29170↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000198690↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 22909↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 15q13.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 15: 30 903 915–30 943 108 (GRCh38)
- Eksonit
- 15 eksonia 39,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 1 017 aminohappoa
- Aiemmat symbolit
- KIAA1018, MTMR15
- MANE Select -transkripti
- ENST00000362065.9NM_014967.5
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/fan1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue FAN1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
DNA-korjausmekanismin häiriöön liittyvä sairaus
- Autosomaalinen resessiivinen
Sairaus, jonka taustalla on DNA:n korjausmekanismien häiriö.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Hemolyyttis-ureeminen oireyhtymä, interstitiaalinen nefriitti
- Interstitiaalinen nefriitti
Munuaisten tubulusten ja munuaisen tukikudosten tulehdus.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
- Karyomegalinen interstitiaalinen nefriittiAutosomaalinen resessiivinen
Mikä tahansa interstitiaalinen nefriitti, jonka syy on FAN1-geenin mutaatio.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
FAN1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,8 kb geenin 39,2 kb:stä; 3 054 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: FAN1
50
FAN1-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 39,2 kb geenistä FAN1, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 4,8 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- APTXaprataxinYhteinen sairaus: 1
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedYhteinen sairaus: 1
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedYhteinen sairaus: 1
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Yhteinen sairaus: 1
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Yhteinen sairaus: 1
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CYhteinen sairaus: 1
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Yhteinen sairaus: 1
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC3ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitYhteinen sairaus: 1
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseYhteinen sairaus: 1
Geeniin FAN1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita FAN1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). FAN1-geeni: FANCD2 and FANCI associated nuclease 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/fan1
Dante Labs. FAN1-geeni: FANCD2 and FANCI associated nuclease 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/fan1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa