Geen
CTSD
cathepsin D
- HGNC 2529↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000117984↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 1509↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11p15.5
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 1 752 755–1 763 927 (GRCh38)
- Eksonid
- 9 eksonit, ulatus 11,2 kb
- Valk
- 412 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- CLN10
- Varasemad tähised
- CPSD
- MANE Select transkript
- ENST00000236671.7NM_001909.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
VõrdlusgenoomGRCh38hg38
Geeni- ja variandilehtede positsioonid järgivad seda valikut selles brauseris.
Loe CTSD ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Neuronaalne tseroid-lipofutsinoos
- Autosoomne retsessiivne
Pärilike progresseeruvate degeneratiivsete ajuhaiguste rühm, mida kliiniliselt iseloomustavad vaimsete ja muude võimete langus, epilepsia ning võrkkesta degeneratsiooni tõttu tekkiv nägemise kadu, ja histopatoloogiliselt autofluorestseeruva aine, tseroid-lipofutsiini, rakusisene kogunemine ajus ja võrkkestas asuvates neuronaalsetes rakkudes.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Laiemad rühmad
Lüsosomaalne ladustamishaigus
- Lüsosomaalne ladustamishaigus (muud ja täpsustamata tüübid)
Üks 59 sellega seotud geenist
Hõlmab lüsosomaalseid ladustamishaigusi, millel ei ole eraldi raportit, näiteks Farberi tõbe ja muid ASAH1-ga seotud häireid, prosaposiini (PSAP) puudulikkusi, multipelset sulfataasi puudulikkust, mukopolüsahharidoosi tüüpe IX ja X ning Dorfman-Chanarini tõbe; pärilikkuse muster sõltub alatüübist, kõige sagedamini autosomaal-retsessiivne.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 4 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas CTSD on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 2,1 kb kogupikkusega 11,2 kb; neist 1239 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse CTSD
43
kohad geenis CTSD, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni CTSD 11,2 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (2,1 kb).
Samade haigustega seotud geenid
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Jagab 2 haigust
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninJagab 2 haigust
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseJagab 2 haigust
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinJagab 2 haigust
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinJagab 2 haigust
- CTSFcathepsin FJagab 2 haigust
- DNAJC5DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5Jagab 2 haigust
- GRNgranulin precursorJagab 2 haigust
- KCTD7potassium channel tetramerization domain containing 7Jagab 2 haigust
- MFSD8major facilitator superfamily domain containing 8Jagab 2 haigust
- PPT1palmitoyl-protein thioesterase 1Jagab 2 haigust
- TPP1tripeptidyl peptidase 1Jagab 2 haigust
Geeniga CTSD seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida CTSD võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). CTSD geen: cathepsin D. Vaadatud 16. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/ctsd
Dante Labs. CTSD geen: cathepsin D [Internet]. [viidatud 16. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/ctsd
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast