Geen
SPG21
SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin
- HGNC 20373↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000090487↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 51324↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 15q22.31
- Koordinaadid
- Kromosoom 15: 64 963 022–64 989 914 (GRCh38)
- Eksonid
- 9 eksonit, ulatus 26,9 kb
- Valk
- 308 aminohapet
- Tuntud ka kui
- ACP33, GL010, BM-019, MAST, ABHD21
- MANE Select transkript
- ENST00000204566.7NM_016630.7
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/spg21.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe SPG21 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Pärilik spastiline paraplegia
- Pärilik spastiline paraplegia (kõik tüübid)
Üks 66 sellega seotud geenist
Üldmõiste, mis hõlmab kõiki pärilikke spastilisi paraplegiaid, sealhulgas SPG4 (SPAST), mis on kõige levinum domineeriv vorm, ning SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ja SPG31.
- 2 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Kuidas SPG21 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 1,8 kb kogupikkusega 26,9 kb; neist 927 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: SPG21
11
SPG21 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu SPG21 geeni 26,9 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 1,8 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Jagab 1 haigust
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseJagab 1 haigust
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Jagab 1 haigust
- AMFRautocrine motility factor receptorJagab 1 haigust
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Jagab 1 haigust
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Jagab 1 haigust
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Jagab 1 haigust
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Jagab 1 haigust
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Jagab 1 haigust
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Jagab 1 haigust
- ATL1atlastin GTPase 1Jagab 1 haigust
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Jagab 1 haigust
Geeniga SPG21 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SPG21 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Dementia
- Difficulty articulating speech
- Increased reflexes
- Periventricular white matter hyperintensities
Näita veel 20 tunnust
- Thin corpus callosum
- Abnormal pyramidal sign
- Motor delay
- Abnormality of peripheral nerve conduction
- Apraxia
- Dysgraphia
- Frontotemporal cerebral atrophy
- Global developmental delay
- Jaw hyperreflexia
- Mental deterioration
- Personality disorder
- Primitive reflex
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormality of extrapyramidal motor function
- Abnormality of the cerebellum
- Involuntary writhing movements in fingers, hands, toes, and feet
- Peripheral neuropathy
- Akinetic mutism
- Difficulty performing quick and alternating movements
- Incoordination
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SPG21 geen: SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/spg21
Dante Labs. SPG21 geen: SPG21 abhydrolase domain containing, maspardin [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/spg21
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast