Geen
GYS1
glycogen synthase 1
- HGNC 4706↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000104812↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 2997↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 19q13.33
- Koordinaadid
- Kromosoom 19: 48 968 130–48 993 309 (GRCh38)
- Eksonid
- 16 eksonit, ulatus 25,2 kb
- Valk
- 737 aminohapet
- Tuntud ka kui
- GSY
- Varasemad tähised
- GYS
- MANE Select transkript
- ENST00000323798.8NM_002103.5
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gys1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe GYS1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Glükogeenoosi haigus
- Lihase glükogeen-süntaasi puudulikkusAutosoomne retsessiivne
Põhjustavad variandid geenis GYS1, mis viivad füüsilise koormuse talumatuseni ja südamelihase haiguseni koos äkilise südameseiskumise riskiga.
- ClinGen hindab seost tasemel kindel
- 4 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Teadmine võimaldab südame jälgimist ning nõuandeid ohutu koormustaseme kohta.
Kuidas GYS1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,6 kb kogupikkusega 25,2 kb; neist 2214 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: GYS1
39
GYS1 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu GYS1 geeni 25,2 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 3,6 kb eksoneid.
Geeniga GYS1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida GYS1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the cardiovascular system
- Decreased myocardial glycogen content
- Fainting spell
- Heart stops beating
- Left atrial enlargement
- Prolonged QTc interval
- Ventricular septal hypertrophy
- Left ventricular hypertrophy
- Sudden cardiac death
Näita veel 2 tunnust
Abnormality of the musculoskeletal system
- Fatty replacement of skeletal muscle
- Limb pain
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Type 1 muscle fiber predominance
- Type 2 muscle fiber atrophy
- Muscle weakness
- Ragged-red muscle fibers
- Skeletal myopathy
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). GYS1 geen: glycogen synthase 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/gys1
Dante Labs. GYS1 geen: glycogen synthase 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/gys1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast