Gen
GYS1
glycogen synthase 1
- HGNC 4706↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000104812↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 2997↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 19q13.33
- Koordinater
- Kromosom 19: 48 968 130–48 993 309 (GRCh38)
- Exoner
- 16 exoner på 25,2 kb
- Protein
- 737 aminosyror
- Även känd som
- GSY
- Tidigare symboler
- GYS
- MANE Select-transkript
- ENST00000323798.8NM_002103.5
- Lokustyp
- Proteinkodande
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
Den här sidan som data
Lägg till .json i sidans adress, eller begär application/json, för att läsa den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gys1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLäs GYS1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Glykogenlagringssjukdom
- MuskelglykogensyntasbristAutosomalt recessiv
Orsakas av varianter i GYS1, som ger nedsatt uthållighet vid träning och hjärtmuskelsjukdom med risk för plötsligt hjärtstillestånd.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 4 GenCC-bedömare bedömer den som definitiv eller stark
▶Åtgärdbarhet
Med kunskapen kan du få hjärtkontroller och råd om säkra träningsnivåer.
Så är GYS1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,6 kb av genens 25,2 kb, och 2 214 av dessa baser kodar för proteinet.
Sekvensering av GYS1
3Låg
Hur svår GYS1 är att sekvensera med korta läsningar, av 100Varje stapel visar andelen av GYS1s exonbaser i den typen av svårt område. Poängen väger dem efter hur mycket var och en försvårar ett kortläsanrop: 0 när ingen bas finns i något, 100 när varje bas finns i alla.
- MappbarhetSträckor där läsningar på 100 eller 250 bp inte kan placeras entydigt, så ett anrop där kan saknas eller vara fel. Vikt 35 %.0 %
- HomologiSegmentella duplikationer: kopior på andra ställen i genomet, till exempel paraloger och pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vikt 30 %.0 %
- UpprepningarTandemupprepningar och serier av en och samma bas, där läsningar glider och kanske inte täcker dem. Vikt 15 %.0,5 %
- GC-innehållFönster med under 25 % eller över 65 % G och C, som biblioteksförberedelsen täcker glest. Vikt 10 %.27 %
- ReferenstäckningLuckor i den närliggande referensassembleringen, där det inte finns någon sekvens som kortläsningarna kan anpassas mot. Vikt 10 %.0 %
39
positioner i GYS1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Ingen av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
Ett helgenomsekvensering täcker alla 25,2 kb av GYS1, inklusive introner, inte bara de 3,6 kb exoner.
Egenskaper kopplade till GYS1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som GYS1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the cardiovascular system
- Decreased myocardial glycogen content
- Fainting spell
- Heart stops beating
- Left atrial enlargement
- Prolonged QTc interval
- Ventricular septal hypertrophy
- Left ventricular hypertrophy
- Sudden cardiac death
Visa ytterligare 2 egenskaper
Abnormality of the musculoskeletal system
- Fatty replacement of skeletal muscle
- Limb pain
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Type 1 muscle fiber predominance
- Type 2 muscle fiber atrophy
- Muscle weakness
- Ragged-red muscle fibers
- Skeletal myopathy
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppta 2026-10-17: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsframkallande positioner och de områden som kortläsningar har svårt för.
- Genome in a Bottle-stratifieringarna från NIST: poängen för sekvenseringssvårighet.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.17-8666dff2.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). GYS1-genen: glycogen synthase 1. Hämtad 18 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gys1
Dante Labs. GYS1-genen: glycogen synthase 1 [Internet]. [citerad 18 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gys1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor