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Gen

NLGN3

neuroligin 3

Resumen

Localización citogenética
Xq13.1
Coordenadas
Cromosoma X: 71.144.841–71.171.201 (GRCh38)
Exones
8 exones en 26,4 kb
Proteína
848 aminoácidos
También conocido como
HNL3, KIAA1480, ASPGX1, AUTSX1
Transcrito MANE Select
ENST00000358741.4NM_181303.2
Tipo de locus
gene with protein product
  • Muy alta
  • Alta
  • Baja
  • Muy baja

Genoma de referenciaGRCh38

Las posiciones en las páginas de genes y variantes siguen esta elección, en este navegador.

Informes revisados relevantes para este gen

  • Trastorno del espectro autista

    • Autismo, predisposición a (formas monogénicas)

      Contribuciones monogénicas al autismo, incluidas las variantes en NLGN3, NLGN4X, PTCHD1, SHANK2, TBR1 y CHD8.

      • 1 remitente de GenCC la califica como definitiva o fuerte

  • Epilepsia (panel completo)

    • Trastorno del neurodesarrollo complejo ligado al cromosoma X

      Un trastorno complejo del neurodesarrollo con un patrón de herencia ligado al cromosoma X, caracterizado por discapacidad intelectual, autismo y epilepsia.

      • ClinGen califica la relación como moderada
      • 1 remitente de GenCC la califica como definitiva o fuerte

Estructura de NLGN3

  • Secuencia codificante
  • Región no traducida
  • Intrón
  • Sentido de la transcripción
  • Sitios conocidos que causan enfermedad
  • Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
Cromosoma X, con un corchete donde se ubica NLGN3. NLGN3 y 16 genes cercanos en el cromosoma X, desde 70.658.021 hasta 71.658.020.Cromosoma XXq13.1p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2870,8 Mb71 Mb71,2 Mb71,4 Mb71,6 MbTEX11: 70.528.940–70.908.711, hebra inversaTEX11SLC7A3: 70.925.556–70.931.149, hebra inversaSLC7A3SNX12: 70.963.111–71.073.426, hebra inversaSNX12FOXO4: 71.095.839–71.103.535, hebra directaCXorf65: 71.103.889–71.106.788, hebra inversaCXorf65: 71.103.987–71.111.575, hebra inversaIL2RG: 71.107.404–71.112.108, hebra inversaIL2RGMED12: 71.118.543–71.144.103, hebra directaMED12NLGN3: 71.144.841–71.171.201, hebra directaNLGN3GJB1: 71.212.811–71.225.519, hebra directaGJB1ZMYM3: 71.239.617–71.255.269, hebra inversaZMYM3NONO: 71.254.270–71.301.522, hebra directaNONOITGB1BP2: 71.301.717–71.305.371, hebra directaITGB1BP2TAF1: 71.366.129–71.532.374, hebra directaTAF1OGT: 71.533.068–71.575.892, hebra directaOGTGCNA: 71.578.436–71.613.590, hebra directaGCNACXCR3: 71.615.912–71.618.545, hebra inversaCXCR3Diagrama de NLGN3: 8 exones en la hebra directa del cromosoma XExón 2: 1 sitio conocido que causa enfermedadExón 5: 1 sitio conocido que causa enfermedadExón 8: 1 sitio conocido que causa enfermedadExón 1: 71.144.841–71.144.964, 124 basesExón 2: 71.147.550–71.148.206, 657 basesExón 3: 71.148.846–71.148.905, 60 basesExón 4: 71.153.477–71.153.536, 60 basesExón 5: 71.155.214–71.155.363, 150 basesExón 6: 71.164.143–71.164.328, 186 basesExón 7: 71.167.011–71.167.800, 790 basesExón 8: 71.169.254–71.171.201, 1948 bases123456785′3′

Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.

Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).

Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.

Los exones suman 4 kb de los 26,4 kb del gen; 2547 de esas bases codifican la proteína.

Cómo lee una prueba genómica el gen NLGN3

3

posiciones en NLGN3 donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico

Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.

Un genoma completo cubre los 26,4 kb de NLGN3, incluidos los intrones, y no solo los 4 kb de exones.

Origen de estos datos

  • HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
  • MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
  • GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
  • La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
  • ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
  • Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
  • Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.

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APA

Dante Labs. (s. f.). Gen NLGN3: neuroligin 3. Consultado el 17 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/nlgn3

Vancouver

Dante Labs. Gen NLGN3: neuroligin 3 [Internet]. [citado 17 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/nlgn3

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