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Gene

NLGN3

neuroligin 3

Sintesi

Localizzazione citogenetica
Xq13.1
Coordinate
Cromosoma X: 71.144.841–71.171.201 (GRCh38)
Esoni
8 esoni su 26,4 kb
Proteina
848 amminoacidi
Noto anche come
HNL3, KIAA1480, ASPGX1, AUTSX1
Trascritto MANE Select
ENST00000358741.4NM_181303.2
Tipo di locus
gene with protein product
  • Molto alta
  • Buona
  • Bassa
  • Molto bassa

Genoma di riferimentoGRCh38

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Report curati rilevanti per questo gene

  • Disturbo dello spettro autistico

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      Contributi monogenici all'autismo, comprese le varianti in NLGN3, NLGN4X, PTCHD1, SHANK2, TBR1 e CHD8.

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      • 1 segnalatore GenCC lo valuta come definitivo o forte

Struttura di NLGN3

  • Sequenza codificante
  • Regione non tradotta
  • Introne
  • Direzione della trascrizione
  • Siti noti causativi di malattia
  • Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Cromosoma X, con una parentesi dove si trova NLGN3. NLGN3 e 16 geni nelle vicinanze sul cromosoma X, da 70.658.021 a 71.658.020.Cromosoma XXq13.1p22.33p22.32p22.31p22.2p22.13p22.12p22.11p21.3p21.2p21.1p11.4p11.3p11.23p11.22p11.21p11.1q11.1q11.2q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.2q21.31q21.32q21.33q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26.1q26.2q26.3q27.1q27.2q27.3q2870,8 Mb71 Mb71,2 Mb71,4 Mb71,6 MbTEX11: 70.528.940–70.908.711, filamento inversoTEX11SLC7A3: 70.925.556–70.931.149, filamento inversoSLC7A3SNX12: 70.963.111–71.073.426, filamento inversoSNX12FOXO4: 71.095.839–71.103.535, filamento direttoCXorf65: 71.103.889–71.106.788, filamento inversoCXorf65: 71.103.987–71.111.575, filamento inversoIL2RG: 71.107.404–71.112.108, filamento inversoIL2RGMED12: 71.118.543–71.144.103, filamento direttoMED12NLGN3: 71.144.841–71.171.201, filamento direttoNLGN3GJB1: 71.212.811–71.225.519, filamento direttoGJB1ZMYM3: 71.239.617–71.255.269, filamento inversoZMYM3NONO: 71.254.270–71.301.522, filamento direttoNONOITGB1BP2: 71.301.717–71.305.371, filamento direttoITGB1BP2TAF1: 71.366.129–71.532.374, filamento direttoTAF1OGT: 71.533.068–71.575.892, filamento direttoOGTGCNA: 71.578.436–71.613.590, filamento direttoGCNACXCR3: 71.615.912–71.618.545, filamento inversoCXCR3Diagramma di NLGN3: 8 esoni sul filamento diretto del cromosoma XEsone 2: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 5: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 8: 1 sito noto causativo di malattiaEsone 1: 71.144.841–71.144.964, 124 basiEsone 2: 71.147.550–71.148.206, 657 basiEsone 3: 71.148.846–71.148.905, 60 basiEsone 4: 71.153.477–71.153.536, 60 basiEsone 5: 71.155.214–71.155.363, 150 basiEsone 6: 71.164.143–71.164.328, 186 basiEsone 7: 71.167.011–71.167.800, 790 basiEsone 8: 71.169.254–71.171.201, 1948 basi123456785′3′

Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.

Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).

Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.

Gli esoni costituiscono 4 kb dei 26,4 kb del gene; 2547 di queste basi codificano la proteina.

Come un test genomico legge NLGN3

3

posizioni in NLGN3 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena

Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.

Un genoma intero copre tutti i 26,4 kb di NLGN3, introni inclusi, non solo i 4 kb di esoni.

Da dove provengono questi dati

  • HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
  • MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
  • GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
  • La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
  • ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
  • The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
  • Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.

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Dante Labs. (s.d.). Gene NLGN3: neuroligin 3. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/nlgn3

Vancouver

Dante Labs. Gene NLGN3: neuroligin 3 [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/nlgn3

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