Genă
KCND3
potassium voltage-gated channel subfamily D member 3
- HGNC 6239↗(se deschide într-un tab nou)
- Genă Ensembl ENSG00000171385↗(se deschide într-un tab nou)
- NCBI Gene 3752↗(se deschide într-un tab nou)
Rezumat
- Localizare citogenetică
- 1p13.2
- Coordonate
- Cromozomul 1: 111.770.662–111.989.668 (GRCh38)
- Exoni
- 8 de exoni pe 219 kb
- Proteină
- 655 de aminoacizi
- Denumiri alternative
- Kv4.3, KSHIVB
- Simboluri anterioare
- SCA22, SCA19
- Transcriptul MANE Select
- ENST00000302127.5NM_001378969.1
- Tip de locus
- Care codifică proteine
- Foarte ridicată
- Ridicată
- Scăzută
- Foarte scăzută
Această pagină ca date
Adăugați .json la adresa paginii sau solicitați application/json pentru a o citi ca JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcnd3.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameCitiți KCND3 și restul genomului dumneavoastră cu un singur test.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni
Comandați Genome Test-ul meuRaport curatoriat relevant pentru această genă
Ataxiile cerebeloase autozomal dominante (SCA și DRPLA)
- Ataxie cerebeloasă autozomal dominantăAutozomal dominantă
Un grup de ataxii cu transmitere dominantă, inclusiv SCA1, SCA2, SCA3 (boala Machado-Joseph), SCA6, SCA7, SCA17, SCA27B și DRPLA, cauzate de expansiuni de repetiții sau variante punctiforme în gene precum ATXN1, ATXN2, ATXN3, CACNA1A, ATXN7, TBP, ATN1 și FGF14.
- 4 de transmițători GenCC o evaluează ca definitivă sau puternică
▶Acționabilitate
Consiliere genetică și testare presimptomatică pentru rude, kinetoterapie și managementul simptomelor; unele forme, cum este SCA27B, pot răspunde la un tratament medicamentos specific.
Structura genei KCND3
- Secvență codificatoare
- Regiune netranslată
- Intron
- Sensul transcripției
- Situri cunoscute asociate bolilor
- Regiuni pe care citirile scurte le găsesc dificile
Exonii transcriptului MANE Select al genei (versiunea v1.5), din NCBI și EMBL-EBI, pe genomul de referință GRCh38.
Benzile cromozomale din ideograma GRCh38 a UCSC (2022-10-29).
Genele din apropiere, din Ensembl, versiunea 116, pe GRCh38.
Exonii reprezintă 7,6 kb din cei 219 kb ai genei; 1.968 dintre aceste baze codifică proteina.
Secvențierea KCND3
1Scăzut
Cât de greu este de secvențiat KCND3 cu citiri scurte, din 100Fiecare bară reprezintă proporția bazelor exonice ale KCND3 aflate în acest tip de regiune dificilă. Scorul le ponderează în funcție de cât de mult afectează fiecare dintre ele apelul din citiri scurte: 0 când nicio bază nu se află în nicio regiune, 100 când fiecare bază se află în toate.
- MapabilitatePorțiuni în care citirile de 100 sau 250 bp nu pot fi plasate unic, deci un apel acolo poate lipsi sau poate fi greșit. Greutate 35 %.0 %
- OmologieDuplicări segmentare: copii în alte părți ale genomului, precum paralogii și pseudogenele, cu o identitate de 90% sau mai mare. Greutate 30 %.0 %
- RepetițiiRepetiții în tandem și secvențe de o singură bază, pe care citirile alunecă și pe care s-ar putea să nu le acopere. Greutate 15 %.4,4 %
- Conținut GCFerestre cu sub 25% sau peste 65% G și C, zone pe care pregătirea bibliotecii le acoperă slab. Greutate 10 %.5 %
- Acoperirea referințeiGoluri în asamblarea de referință din apropiere, unde nu există nicio secvență la care citirile să se poată alinia. Greutate 10 %.0 %
20
poziții în KCND3 unde ClinVar clasifică o modificare drept patogenă sau probabil patogenă
Niciuna dintre acestea nu se află într-o regiune pe care citirile scurte o găsesc dificilă.
Un genom întreg acoperă toți cei 219 kb ai lui KCND3, inclusiv intronii, nu doar cei 7,6 kb de exoni.
Gene asociate acelorași afecțiuni
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Are 1 afecțiune în comun
- ATN1atrophin 1Are 1 afecțiune în comun
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Are 1 afecțiune în comun
- ATXN1ataxin 1Are 1 afecțiune în comun
- ATXN10ataxin 10Are 1 afecțiune în comun
- ATXN2ataxin 2Are 1 afecțiune în comun
- ATXN3ataxin 3Are 1 afecțiune în comun
- ATXN7ataxin 7Are 1 afecțiune în comun
- BEAN1brain expressed associated with NEDD4 1Are 1 afecțiune în comun
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 AAre 1 afecțiune în comun
- CACNA1Gcalcium voltage-gated channel subunit alpha1 GAre 1 afecțiune în comun
- CAMTA1calmodulin binding transcription activator 1Are 1 afecțiune în comun
Trăsături asociate cu KCND3
Human Phenotype Ontology le enumeră drept caracteristici ale afecțiunilor rare pe care le poate provoca KCND3. Pagina fiecărei trăsături enumeră celelalte gene asociate cu aceasta.
Legături externe
Înregistrări ale genei
Transcript
Proteină
De unde provin aceste date
- HGNC: simbolul genei, denumirea, celelalte simboluri și localizarea.
- MANE Select v1.5, de la NCBI și EMBL-EBI: transcriptul, exonii și secvența codificatoare.
- GenCC și ClinGen, versiunea 2026-10-17: cu ce afecțiuni este asociată gena și cât de puternică este această asociere.
- Lista ACMG a rezultatelor secundare, SF v3.2.
- ClinVar și stratificările GIAB: poziții cunoscute asociate bolilor și regiunile în care citirile scurte întâmpină dificultăți.
- Stratificările genomului Genome in a Bottle, de la NIST: scorul de dificultate a secvențierii.
- Human Phenotype Ontology, versiunea 2026-09-01: trăsăturile asociate genei. Aflați mai multe la hpo.jax.org.
- Versiunea datelor 2026.10.17-8666dff2.
Citează această pagină
Dante Labs. (s.a.). Gena KCND3: potassium voltage-gated channel subfamily D member 3. Accesat 18 octombrie 2026, de la https://dantelabs.com/ro/genes/kcnd3
Dante Labs. Gena KCND3: potassium voltage-gated channel subfamily D member 3 [Internet]. [citat 18 octombrie 2026]. Disponibil la: https://dantelabs.com/ro/genes/kcnd3
Un test. Răspunsuri pentru o viață.
De la 449 $Livrare gratuită · Rezultate în 6–8 săptămâni