Gen
SCNN1G
sodium channel epithelial 1 subunit gamma
- HGNC 10602↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000166828↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6340↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 16p12.2
- Współrzędne
- Chromosom 16: 23 182 745–23 216 883 (GRCh38)
- Eksony
- 13 eksonów na odcinku 34,1 kb
- Białko
- 649 aminokwasów
- Znany również jako
- ENaCgamma, SCNEG
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000300061.3NM_001039.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/scnn1g.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj SCNN1G oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Monogenicznie uwarunkowane nadciśnienie i zaburzenia mineralokortykoidowe
- Zespół Liddle'aAutosomalne dominujące
Nadaktywny kanał sodowy w nerkach, wywołany zmianami w genach SCNN1B, SCNN1G lub SCNN1A, prowadzący do nadciśnienia tętniczego o wczesnym początku, często z niskim poziomem potasu i niskim poziomem aldosteronu.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Znajomość tego schorzenia wskazuje na leczenie amilorydem lub triamterenem, które działają bezpośrednio na nadaktywny kanał.
- Pseudohipoaldosteronizm typu 1
Schorzenie z utratą soli, w którym organizm nie reaguje na aldosteron, wywołane zmianami w genie NR3C2 (łagodniejsza postać ograniczona do nerek) lub w genach kanałów sodowych SCNN1 (cięższa postać wieloukładowa).
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Znajomość tego schorzenia wspiera wczesne suplementowanie soli oraz monitorowanie poziomu potasu w niemowlęctwie.
Budowa genu SCNN1G
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 3,5 kb z 34,1 kb genu; 1950 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie SCNN1G
1Łatwy
Stopień trudności sekwencjonowania genu SCNN1G krótkimi odczytami w skali 0–100
0 · Łatwy100 · Trudny
Niemal wszystkie eksony genu SCNN1G znajdują się w miejscach, gdzie krótkie odczyty są mapowane poprawnie.
Co dokłada się do wyniku: udział eksonów genu SCNN1G w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się umieścić jednoznacznie, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych częściach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub większej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować w całości. Waga 15%.3%
- Zawartość GCOkna z mniej niż 25% lub więcej niż 65% zawartości G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Waga 10%.2%
- Pokrycie referencjiLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, gdzie nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Waga 10%.0%
Wynik Dante Labs z własnych badań, oparty na mapach trudno sekwencjonowalnych regionów NIST Genome in a Bottle.Jak liczymy wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów genu SCNN1G w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie leży w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się tam, gdzie odczytów nie da się umieścić jednoznacznie.
2
pozycje w SCNN1G, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 34,1 kb genu SCNN1G, łącznie z intronami, a nie tylko 3,5 kb eksonów.
ClinVar pathogenic variants (3)
The SCNN1G variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenny 1
- Prawdopodobnie patogenny 2
| Wariant | Conditions | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|
| NM_001039.4(SCNN1G):c.412C>T (p.Arg138Ter) (opens in a new tab) | bronchiectasis with or without elevated sweat chloride 3 | Patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001039.4(SCNN1G):c.142dup (p.Arg48fs) (opens in a new tab) | Liddle syndrome 2 and 1 other | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
| NM_001039.4(SCNN1G):c.416_417del (p.Glu139fs) (opens in a new tab) | Liddle syndrome 2 and 2 others | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★1 gwiazdka z 4 podano kryteria, jeden zgłaszający |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
Cechy powiązane z genem SCNN1G
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SCNN1G. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-18: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.18-8b139e39.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SCNN1G: sodium channel epithelial 1 subunit gamma. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/scnn1g
Dante Labs. Gen SCNN1G: sodium channel epithelial 1 subunit gamma [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/scnn1g
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni