Gen
MSH2
mutS homolog 2
- HGNC 7325↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000095002↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 4436↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 2p21-p16.3
- Współrzędne
- Chromosom 2: 47 403 156–47 483 223 (GRCh38)
- Eksony
- 16 eksonów na odcinku 80,1 kb
- Białko
- 934 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące Autosomalne recesywne
- Znany również jako
- HNPCC, HNPCC1, MSH-2
- Poprzednie symbole
- COCA1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000233146.7NM_000251.3
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj MSH2 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Choroba naprawy DNA
- Autosomalne recesywne
Choroba, której podłożem jest zaburzenie mechanizmów naprawy DNA.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 3 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Zespół Lyncha
- Zespół Muira-Torre'aAutosomalne dominujące
Postać zespołu Lyncha, zwykle wywoływana wariantami w genach MSH2 lub MLH1, w której obok nowotworów wewnętrznych występują nowotwory gruczołów łojowych skóry lub rogowiaki kolczystokomórkowe.
- 1 podmiot GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Monitorowanie w kierunku zespołu Lyncha oraz regularne badanie skóry.
- Autosomalne dominujące
Dziedziczny niepolipowaty rak jelita grubego, wywołany zarodkowymi defektami naprawy niedopasowań, z wczesnym występowaniem raka jelita grubego, trzonu macicy i innych nowotworów.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
- Na liście ACMG wtórnych wyników badania
Co zmienia znajomość wyniku
Rozszerzona kontrola kolonoskopowa, profilaktyka aspiryną, inhibitory punktów kontrolnych odporności w guzach o wysokiej niestabilności mikrosatelitarnej (MSI-high), kaskadowe badania krewnych, zabiegi ginekologiczne zmniejszające ryzyko
Dziedziczenie
- Autosomalne dominujące
- Wystarczy jedna zmieniona kopia, od któregokolwiek z rodziców. Rodzic, który ją ma, przekazuje ją każdemu dziecku z szansą jeden do dwóch.
- Autosomalne recesywne
- Potrzebna jest zmieniona kopia od każdego z rodziców. Przy jednej zmienionej kopii osoba jest nosicielem i zwykle nie ma objawów; gdy oboje rodzice są nosicielami, każde dziecko ma szansę jeden do czterech odziedziczyć dwie kopie.
Budowa genu MSH2
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 3,1 kb z 80,1 kb genu; 2805 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje MSH2
1293
pozycje w MSH2, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
1 z nich (0,1%) przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappability (1 miejsce)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 80,1 kb genu MSH2, łącznie z intronami, a nie tylko 3,1 kb eksonów.
Warianty z podstroną (540)
Warianty MSH2 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A123Vfs*51 | c.368del | Ekson 3 | 47 410 094 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A230Lfs*16 | c.687del | Ekson 4 | 47 412 448 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A230Sfs*2 | c.687dup | Ekson 4 | 47 412 448 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A266Qfs*8 | c.795del | Ekson 5 | 47 414 269 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A370Qfs*3 | c.1108del | Ekson 7 | 47 429 772 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A398Gfs*19 | c.1192dup | Ekson 7 | 47 429 856 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A499Cfs*14 | c.1494dup | Ekson 9 | 47 463 137 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A500Pfs*26 | c.1497del | Ekson 9 | 47 463 140 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A573Pfs*17 | c.1717del | Ekson 11 | 47 471 019 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A636P | c.1906G>C | Ekson 12 | 47 475 171 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- MLH1mutL homolog 1Wspólnych schorzeń: 3
- MSH6mutS homolog 6Wspólnych schorzeń: 2
- PMS2PMS1 homolog 2, mismatch repair system componentWspólnych schorzeń: 2
- APTXaprataxinWspólne schorzenie: 1
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedWspólne schorzenie: 1
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedWspólne schorzenie: 1
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Wspólne schorzenie: 1
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Wspólne schorzenie: 1
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CWspólne schorzenie: 1
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Wspólne schorzenie: 1
- EPCAMepithelial cell adhesion moleculeWspólne schorzenie: 1
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem MSH2
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać MSH2. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Glioblastoma multiforme
- Anxiety
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Depression
- Epilepsy
- Irritability
- Migraine
Pokaż jeszcze 15 cech
- Rise in pressure inside skull
- Abnormal gait
- Abnormal pyramidal sign
- Abnormal speech pattern
- Benign neoplasm of the central nervous system
- Cancer of early nerve cells
- Difficulty articulating speech
- Disorder of involuntary muscle movements
- Disturbed sensory perception
- Dysgraphia
- Hallucinations
- Loss of developmental milestones
- Memory impairment
- Paralysis or weakness of one side of body
- Pins and needles feeling
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen MSH2: mutS homolog 2. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/msh2
Dante Labs. Gen MSH2: mutS homolog 2 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/msh2
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni