Gén
HMGCS2
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2
- HGNC 5008↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000134240↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 3158↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 1p12
- Koordináták
- 1. kromoszóma: 119 748 002–119 768 905 (GRCh38)
- Exonok
- 10 exon, összesen 20,9 kb
- Fehérje
- 508 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális recesszív
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000369406.8NM_005518.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a HMGCS2-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentés
Fatty Acid Oxidation & Carnitine Cycle Disorders
- Disorders of Fatty Acid Oxidation and KetogenesisAutoszomális recesszív
A group of enzyme and transporter defects, including MCAD, VLCAD, LCHAD, SCAD and HADH deficiency, primary carnitine deficiency and carnitine-acylcarnitine translocase deficiency, that can cause low blood sugar, muscle breakdown, heart and liver problems during periods of fasting or illness.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 4 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
Knowing allows avoidance of prolonged fasting, an emergency plan for illness and, where relevant, carnitine or dietary fat modification, which can prevent life-threatening episodes.
Öröklődési mód
- Autoszomális recesszív
- Mindkét szülőtől egy-egy megváltozott másolat szükséges. Egy megváltozott másolattal hordozó lesz, és általában nem érintett; ha mindkét szülő hordozó, minden gyermeknek 25%-os eséllyel öröklődik mindkét másolat.
A HMGCS2 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 20,9 kb-jából 2,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1527 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) HMGCS2 gént
48
pozíció a(z) HMGCS2 génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a HMGCS2 gén mind a 20,9 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 2,4 kb exonját.
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 91 betegséget oszt meg
- ACADMacyl-CoA dehydrogenase medium chain1 betegséget oszt meg
- ACADSacyl-CoA dehydrogenase short chain1 betegséget oszt meg
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chain1 betegséget oszt meg
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alpha1 betegséget oszt meg
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit beta1 betegséget oszt meg
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenase1 betegséget oszt meg
- HADHhydroxyacyl-CoA dehydrogenase1 betegséget oszt meg
- HADHAhydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alpha1 betegséget oszt meg
- HMGCL3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase1 betegséget oszt meg
- SLC22A5solute carrier family 22 member 51 betegséget oszt meg
- SLC25A20solute carrier family 25 member 201 betegséget oszt meg
A(z) HMGCS2 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) HMGCS2 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Laboratory abnormality
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Increased circulating free fatty acid level
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Low blood phosphate level
- Elevated urinary 3-hydroxybutyric acid
- Elevated urinary dicarboxylic acid level
- Fatty infiltration of liver
Még 5 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). HMGCS2 gén: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/hmgcs2
Dante Labs. HMGCS2 gén: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2 [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/hmgcs2
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt