Gen
C9orf72
C9orf72-SMCR8 complex subunit
- HGNC 28337↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000147894↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 203228↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 9p21.2
- Współrzędne
- Chromosom 9: 27 546 546–27 573 481 (GRCh38)
- Eksony
- 11 eksonów na odcinku 26,9 kb
- Białko
- 481 aminokwasów
- Znany również jako
- MGC23980, DENNL72, DENND9
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000380003.8NM_018325.5
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/c9orf72.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj C9orf72 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Stwardnienie zanikowe boczne (ALS)
- Stwardnienie zanikowe boczne
Choroba neurodegeneracyjna górnych i dolnych neuronów ruchowych, występująca w postaci sporadycznej i rodzinnej.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Tofersen (Qalsody, FDA 2023) w SOD1-ALS; badania ASO dla C9orf72 i FUS; riluzol; edaravon; AMX0035 (fenylomaślan sodu i taurursodiol); kompleksowa opieka wielospecjalistycznej poradni ALS; wsparcie oddechowe; poradnictwo genetyczne dla członków rodziny
Otępienie czołowo-skroniowe
- Otępienie czołowo-skroniowe i/lub stwardnienie zanikowe boczneAutosomalne dominujące
Nazwa zbiorcza dla genetycznego spektrum otępienia czołowo-skroniowego i stwardnienia zanikowego bocznego, obejmująca postacie wywołane przez geny C9orf72, TBK1, VCP, SQSTM1 oraz inne geny.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Szersze grupy
Dziedziczne choroby neurodegeneracyjne
- Choroba neurodegeneracyjna związana z genem KIF5AAutosomalne dominujące
Jeden z 372 powiązanych z nim genów
Wywoływana przez zmiany w jednej kopii genu KIF5A, który koduje białko motoryczne z końcówką wiążącą ładunek. Różne rodzaje zmian prowadzą do różnych schorzeń: dziedzicznego porażenia spastycznego typu 10, aksonalnej postaci choroby Charcota-Mariego-Tootha oraz stwardnienia zanikowego bocznego (ALS).
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 2 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Leczenie ma charakter objawowy i zależy od obrazu klinicznego; obejmuje fizjoterapię, leki przeciwspastyczne oraz wielospecjalistyczną opiekę w przypadku ALS. Każde dziecko osoby chorej ma 1 szansę na 2 odziedziczenia zmiany; poradnictwo genetyczne pomaga rodzinom zrozumieć to ryzyko.
Budowa genu C9orf72
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 3,2 kb z 26,9 kb genu; 1446 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie C9orf72
3Łatwo
Jak trudno zsekwencjonować C9orf72 krótkimi odczytami, w skali do 100
0 · Łatwo100 · Trudno
Niemal wszystkie eksony C9orf72 znajdują się w miejscach, które krótkie odczyty mapują bez problemu.
Co na to wpływa: udział eksonów C9orf72 w każdym rodzaju trudnego regionu
- MapowalnośćOdcinki, w których odczytów 100 lub 250 bp nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu może tam brakować lub być błędne. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 100.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o zgodności 90% lub więcej. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 60.0%
- Wspólne z chrYRegiony pseudoautosomalne i region X-transpozycji, w których chrX i chrY mają tę samą lub niemal tę samą sekwencję, dlatego odczyt z jednego może zostać przypisany do drugiego. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 60.0%
- Pokrycie sekwencji referencyjnejLuki w pobliskim składzie sekwencji referencyjnej, w których nie ma sekwencji, do której odczyty mogłyby się dopasować. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 50.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i ciągi jednej zasady, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 30.2,7%
- Zawartość GCOkna z poniżej 25% lub powyżej 65% G i C, które przygotowanie biblioteki pokrywa słabo. Gen położony w całości w tego rodzaju regionie sam w sobie otrzymałby wynik 20.9,8%
Wynik Dante Labs z naszych własnych badań, oparty na mapach trudnych do zsekwencjonowania regionów Genome in a Bottle z NIST.Jak obliczany jest wynikKażdy słupek to udział zasad eksonów C9orf72 w danym rodzaju trudnego regionu. Każdy rodzaj może sam w sobie uczynić gen trudnym, a każdy kolejny dodaje coraz mniej: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w żadnym z nich, 100, gdy każda zasada leży tam, gdzie odczytów nie da się jednoznacznie umieścić.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- CCNFcyclin FWspólnych schorzeń: 3
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Wspólnych schorzeń: 3
- CHMP2Bcharged multivesicular body protein 2BWspólnych schorzeń: 3
- CYLDCYLD lysine 63 deubiquitinaseWspólnych schorzeń: 3
- SQSTM1sequestosome 1Wspólnych schorzeń: 3
- TBK1TANK binding kinase 1Wspólnych schorzeń: 3
- VCPvalosin containing proteinWspólnych schorzeń: 3
- ALS2alsin Rho guanine nucleotide exchange factor ALS2Wspólnych schorzeń: 2
- ANGangiogeninWspólnych schorzeń: 2
- ANXA11annexin A11Wspólnych schorzeń: 2
- DCTN1dynactin subunit 1Wspólnych schorzeń: 2
- ERBB4erb-b2 receptor tyrosine kinase 4Wspólnych schorzeń: 2
Cechy powiązane z genem C9orf72
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać C9orf72. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-19: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.19-9814e911.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen C9orf72: C9orf72-SMCR8 complex subunit. Pobrano 20 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/c9orf72
Dante Labs. Gen C9orf72: C9orf72-SMCR8 complex subunit [Internet]. [cytowano 20 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/c9orf72
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni