Gen
TSFM
Ts translation elongation factor, mitochondrial
- HGNC 12367↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000123297↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 10102↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 12q14.1
- Coördinaten
- Chromosoom 12: 57.782.787–57.797.587 (GRCh38)
- Exons
- 6 exons over 14,8 kb
- Eiwit
- 325 aminozuren
- Ook bekend als
- EF-Tsmt, EF-TS
- MANE Select-transcript
- ENST00000652027.2NM_005726.6
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tsfm.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees TSFM en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Primaire mitochondriële ziekte
- Gecombineerde deficiëntie van oxidatieve fosforylering
Aandoeningen, meestal veroorzaakt door nucleaire genen die betrokken zijn bij de productie van mitochondriale eiwitten. Ze verminderen meerdere ademhalingsketencomplexen tegelijk en veroorzaken vaak ernstige ziekte van meerdere organen in de kindertijd.
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Weten kan een diagnostisch zoektraject beëindigen en helpt bij controle en ondersteunende zorg.
Bredere groeperingen
Syndroom van Leigh
Een van 69 genen die hiermee verband houden
Een progressieve neurologische aandoening, gekenmerkt door specifieke neuropathologische kenmerken waarbij laesies in de hersenstam en de basale ganglia samen voorkomen.
- ClinGen beoordeelt het verband als matig
Opbouw van TSFM
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 2 kb van de 14,8 kb van het gen; 978 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van TSFM
55
posities in TSFM waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 14,8 kb van TSFM, inclusief intronen, en niet alleen de 2 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Deelt 2 aandoeningen
- EARS2glutamyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeelt 2 aandoeningen
- FARS2phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeelt 2 aandoeningen
- GFM1G elongation factor mitochondrial 1Deelt 2 aandoeningen
- GFM2GTP dependent ribosome recycling factor mitochondrial 2Deelt 2 aandoeningen
- GTPBP3GTP binding protein 3, mitochondrialDeelt 2 aandoeningen
- MRPS34mitochondrial ribosomal protein S34Deelt 2 aandoeningen
- MTFMTmitochondrial methionyl-tRNA formyltransferaseDeelt 2 aandoeningen
- MTRFRmitochondrial translation release factor in rescueDeelt 2 aandoeningen
- PNPT1polyribonucleotide nucleotidyltransferase 1Deelt 2 aandoeningen
- AARS2alanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeelt 1 aandoening
- ATP5F1AATP synthase F1 subunit alphaDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan TSFM
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die TSFM kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Encephalopathy
- Grand mal seizures
- Lack of feeling, emotion, interest
- Ventriculomegaly
- Ataxia
- Cognitive impairment
- Dystonia
- Epilepsy
Toon 2 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). TSFM-gen: Ts translation elongation factor, mitochondrial. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/tsfm
Dante Labs. TSFM-gen: Ts translation elongation factor, mitochondrial [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/tsfm
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken