Gen
TFG
trafficking from ER to golgi regulator
- HGNC 11758↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000114354↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 10342↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 3q12.2
- Coördinaten
- Chromosoom 3: 100.709.494–100.748.964 (GRCh38)
- Exons
- 8 exons over 39,5 kb
- Eiwit
- 400 aminozuren
- Ook bekend als
- TF6, FLJ36137, SPG57
- MANE Select-transcript
- ENST00000240851.9NM_006070.6
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tfg.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees TFG en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Erfelijke spastische paraplegie
- Hereditaire spastische paraplegie (alle typen)
Een van 66 genen die hiermee verband houden
Overkoepelende term voor alle hereditaire spastische paraplegieën, waaronder SPG4 (SPAST), de meest voorkomende dominante vorm, en SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 en SPG31.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van TFG
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,9 kb van de 39,5 kb van het gen; 1.203 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van TFG
2Laag
Hoe moeilijk TFG met korte reads te sequencen is, op een schaal van 100Elke balk is het aandeel van de exonbasen van TFG in dat type moeilijke regio. De score weegt deze naar hoeveel elk een short-read-call kost: 0 wanneer geen enkele base in een van deze regio's valt, 100 wanneer elke base in alle regio's valt.
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek geplaatst kunnen worden, waardoor een call daar kan ontbreken of onjuist kan zijn. Gewicht 35%.0%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen schuiven en die ze mogelijk niet overbruggen. Gewicht 15%.0%
- GC-gehalteVensters onder 25% of boven 65% G en C, die de bibliotheekvoorbereiding slechts dun dekt. Gewicht 10%.17%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentieassemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Gewicht 10%.0%
4
posities in TFG waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen ervan valt in een gebied dat korte reads lastig vinden.
Een volledig genoom dekt alle 39,5 kb van TFG, inclusief intronen, en niet alleen de 1,9 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deelt 1 aandoening
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseDeelt 1 aandoening
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Deelt 1 aandoening
- AMFRautocrine motility factor receptorDeelt 1 aandoening
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Deelt 1 aandoening
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Deelt 1 aandoening
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Deelt 1 aandoening
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Deelt 1 aandoening
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Deelt 1 aandoening
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Deelt 1 aandoening
- ATL1atlastin GTPase 1Deelt 1 aandoening
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan TFG
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die TFG kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Abnormality of peripheral nerve conduction
- Babinski sign
- Delayed ability to walk
- Demyelinating motor neuropathy
- Increased reflexes
- Loss of ability to walk
- Abnormal myelination
- Abnormal peripheral action potential amplitude
Toon 22 kenmerken meer
- Absent reflexes
- Inability to walk
- Motor polyneuropathy
- Nerve damage causing decreased feeling and movement
- Peripheral neuropathy
- Somatic sensory dysfunction
- Abnormal cranial nerve physiology
- Bulbar signs
- Decreased sensation in extremities
- Tremor
- Twitching
- Abnormal seventh cranial physiology
- Hand tremor
- Lower cranial nerve dysfunction
- Abnormal gait
- Axonal degeneration
- Damage to nerves that sense feeling
- Decreased number of peripheral myelinated nerve fibers
- Degeneration of anterior horn cells
- Gliosis
- Muscle twitch
- Paralysis of all four limbs
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-17: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). TFG-gen: trafficking from ER to golgi regulator. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/tfg
Dante Labs. TFG-gen: trafficking from ER to golgi regulator [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/tfg
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken