Gen
HPDL
4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase like
- HGNC 28242↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000186603↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 84842↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 1p34.1
- Coördinaten
- Chromosoom 1: 45.326.895–45.328.710 (GRCh38)
- Exons
- 1 exon over 1,8 kb
- Eiwit
- 371 aminozuren
- Ook bekend als
- MGC15668, 4-HPPD-L
- Eerdere symbolen
- GLOXD1
- MANE Select-transcript
- ENST00000334815.6NM_032756.4
- Type locus
- Protein-coding
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hpdl.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees HPDL en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Erfelijke spastische paraplegie
- Hereditaire spastische paraplegie (alle typen)
Een van 66 genen die hiermee verband houden
Overkoepelende term voor alle hereditaire spastische paraplegieën, waaronder SPG4 (SPAST), de meest voorkomende dominante vorm, en SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 en SPG31.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Syndroom van Leigh
Een van 69 genen die hiermee verband houden
Een progressieve neurologische aandoening, gekenmerkt door specifieke neuropathologische kenmerken waarbij laesies in de hersenstam en de basale ganglia samen voorkomen.
- ClinGen beoordeelt het verband als matig
Opbouw van HPDL
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,8 kb van de 1,8 kb van het gen; 1.116 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van HPDL
15
posities in HPDL waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
Geen daarvan valt in een gebied waar korte reads moeilijk zijn.
Een whole genome dekt alle 1,8 kb van HPDL, inclusief intronen, en niet alleen de 1,8 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- FARS2phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeelt 2 aandoeningen
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deelt 1 aandoening
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseDeelt 1 aandoening
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Deelt 1 aandoening
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Deelt 1 aandoening
- AMFRautocrine motility factor receptorDeelt 1 aandoening
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Deelt 1 aandoening
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Deelt 1 aandoening
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Deelt 1 aandoening
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Deelt 1 aandoening
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Deelt 1 aandoening
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan HPDL
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die HPDL kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-17: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). HPDL-gen: 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase like. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/hpdl
Dante Labs. HPDL-gen: 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase like [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/hpdl
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken