Gen
HPDL
4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase like
- HGNC 28242↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000186603↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 84842↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1p34.1
- Koordinater
- Kromosom 1: 45 326 895–45 328 710 (GRCh38)
- Eksoner
- 1 ekson over 1,8 kb
- Protein
- 371 aminosyrer
- Også kjent som
- MGC15668, 4-HPPD-L
- Tidligere symboler
- GLOXD1
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000334815.6NM_032756.4
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hpdl.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes HPDL og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Arvelig spastisk paraplegi
- Arvelig spastisk paraplegi (alle typer)
Ett av 66 gener knyttet til den
Samlebetegnelse for alle arvelige spastiske paraplegier, inkludert SPG4 (SPAST), den vanligste dominante formen, samt SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 og SPG31.
- 1 GenCC-innsender vurderer den som definitiv eller sterk
Leighs syndrom
Ett av 69 gener knyttet til den
En progressiv nevrologisk sykdom preget av spesifikke nevropatologiske trekk, med lesjoner i hjernestammen og basalgangliene.
- ClinGen vurderer koblingen som moderat
Slik er HPDL bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 1,8 kb av genets 1,8 kb, og 1 116 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av HPDL
15
posisjoner i HPDL der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 1,8 kb av HPDL, inkludert introner, ikke bare de 1,8 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- FARS2phenylalanyl-tRNA synthetase 2, mitochondrialDeler 2 tilstander
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Deler 1 tilstand
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseDeler 1 tilstand
- AIFM1apoptosis inducing factor mitochondria associated 1Deler 1 tilstand
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Deler 1 tilstand
- AMFRautocrine motility factor receptorDeler 1 tilstand
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Deler 1 tilstand
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Deler 1 tilstand
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Deler 1 tilstand
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Deler 1 tilstand
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Deler 1 tilstand
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til HPDL
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene HPDL kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). HPDL-genet: 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase like. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/hpdl
Dante Labs. HPDL-genet: 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase like [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/hpdl
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker