Gen
ANAPC1
anaphase promoting complex subunit 1
- HGNC 19988↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000153107↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 64682↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 2q13
- Coördinaten
- Chromosoom 2: 111.767.640–111.884.193 (GRCh38)
- Exons
- 48 exons over 116,6 kb
- Eiwit
- 1.944 aminozuren
- Ook bekend als
- MCPR, TSG24, APC1
- MANE Select-transcript
- ENST00000341068.8NM_022662.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/anapc1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees ANAPC1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Rothmund-Thomson-syndroom
- Autosomaal recessief
Een genodermatose met poikiloderma, dun haar, kleine lichaamslengte, skeletafwijkingen en, bij type 2 (RECQL4), een verhoogd risico op osteosarcoom en huidkanker.
- ClinGen beoordeelt het verband als matig
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Let op botpijn of zwelling als mogelijke tekenen van osteosarcoom, controleer uw huid regelmatig en bescherm uzelf tegen de zon; dragers hebben naar verwachting geen gezondheidseffecten.
Opbouw van ANAPC1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 7,8 kb van de 116,6 kb van het gen; 5.835 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing ANAPC1
61Moeilijk
Hoe moeilijk ANAPC1 is om met korte reads te sequencen, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Een groot deel van ANAPC1 ligt op plaatsen waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd plaatsen.
Wat er nog bij komt: het aandeel van de exonen van ANAPC1 in elk soort moeilijke regio
- MappabilityStukken waar reads van 100 of 250 bp niet uniek kunnen worden geplaatst, zodat een call daar mogelijk ontbreekt of fout is. Gewicht 35%.91%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, bij 90% identiteit of meer. Gewicht 30%.97%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die mogelijk niet volledig worden overspannen. Gewicht 15%.0,3%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die de bibliotheekbereiding dun dekt. Gewicht 10%.3,2%
- ReferentiedekkingGaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen uitlijnen. Gewicht 10%.0%
Een score van Dante Labs op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Hoe de score wordt berekendElke balk is het aandeel van de exonbasen van ANAPC1 in dat soort moeilijke regio. Elk soort kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra soort voegt steeds minder toe: 0 als geen enkele base in een regio ligt, 100 als elke base op een plek ligt waar reads niet uniek kunnen worden geplaatst.
2
posities in ANAPC1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen indeelt
2 daarvan (100%) vallen in regio's die korte reads moeilijk vinden.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (2 locaties)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (2 locaties)
Een volledig genoom dekt alle 116,6 kb van ANAPC1, inclusief intronen, en niet alleen de 7,8 kb aan exonen.
ClinVar pathogenic variants (2)
The ANAPC1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen 2
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_022662.4(ANAPC1):c.4373+1G>A (opens in a new tab) | Rothmund-Thomson syndrome type 1 | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_022662.4(ANAPC1):c.1393C>T (p.Gln465Ter) (opens in a new tab) | Rothmund-Thomson syndrome type 1 | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
Kenmerken gekoppeld aan ANAPC1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die ANAPC1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of head or neck
- Abnormal dentition
- Absent eyebrow
- Absent eyelashes
- Abnormal tooth enamel
- Cone shaped tooth
- Decreased number of teeth
- Decreased size of tooth
- Delayed eruption of teeth
Toon 4 kenmerken meer
Abnormality of limbs
- Metaphyseal striations
- Plantar hyperkeratosis
- Abnormal ulnar metaphysis morphology
- Abnormality of the radial head
- Absent kneecap
- Fused finger bones
- Increased bone density in wide portion of long bone
- Outward bow-leggedness
Toon 3 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-17: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.17-8666dff2.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). ANAPC1-gen: anaphase promoting complex subunit 1. Geraadpleegd op 18 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/anapc1
Dante Labs. ANAPC1-gen: anaphase promoting complex subunit 1 [Internet]. [geraadpleegd 18 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/anapc1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken