Genas
PGAP1
post-GPI attachment to proteins inositol deacylase 1
- HGNC 25712↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000197121↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 80055↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 2q33.1
- Koordinatės
- Chromosoma 2: 196 833 004–196 926 707 (GRCh38)
- Eksonai
- 27 eksonų per 93,7 kb
- Baltymas
- 922 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- FLJ12377, Bst1, SPG67
- MANE Select transkriptas
- ENST00000354764.9NM_024989.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite PGAP1 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Intelektinė negalia
Vienas iš 233 su juo susijusių genų
- 3 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Kaip išdėstytas PGAP1
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 11,1 kb iš 93,7 kb geno; 2 769 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito PGAP1
30
PGAP1 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 93,7 kb PGAP1 geno, įskaitant intronus, o ne tik 11,1 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Turi 1 bendrą būklę
- ADKadenosine kinaseTuri 1 bendrą būklę
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxTuri 1 bendrą būklę
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Turi 1 bendrą būklę
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Turi 1 bendrą būklę
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseTuri 1 bendrą būklę
- ANK3ankyrin 3Turi 1 bendrą būklę
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Turi 1 bendrą būklę
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Turi 1 bendrą būklę
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Turi 1 bendrą būklę
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Turi 1 bendrą būklę
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ATuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su PGAP1
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti PGAP1, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the nervous system
- Babinski sign
- Degeneration of cerebrum
- Delayed ability to roll over
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to walk
- Delayed CNS myelination
- Delayed speech and language development
- Disorder of involuntary muscle movements
Rodyti dar 23 savybių
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
- Motor delay
- Repetitive movements
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Abnormality of movement
- Absent speech development
- Agenesis of corpus callosum
- Aplasia/Hypoplasia of the cerebellar vermis
- Brief seizures with staring spells
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed ability to crawl
- Enlarged sylvian cistern
- Grand mal seizures
- Inappropriate laughter
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
- Limb tremor
Abnormality of head or neck
- Abnormal dentition
- Depressed nasal bridge
- Highly arched eyebrow
- Short neck
- Thin dental enamel
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide mouth
- Abnormally small head
Rodyti dar 3 savybių
Abnormality of the musculoskeletal system
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Low muscle tone
- Low muscle tone in trunk
- Lower limb spasticity
- Muscle degeneration
- Progressive spastic paraplegia
Rodyti dar 2 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). PGAP1 genas: post-GPI attachment to proteins inositol deacylase 1. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/pgap1
Dante Labs. PGAP1 genas: post-GPI attachment to proteins inositol deacylase 1 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/pgap1
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites