Gen
PGAP1
post-GPI attachment to proteins inositol deacylase 1
- HGNC 25712↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000197121↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 80055↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 2q33.1
- Koordinater
- Kromosom 2: 196.833.004–196.926.707 (GRCh38)
- Exoner
- 27 exoner fordelt over 93,7 kb
- Protein
- 922 aminosyrer
- Også kendt som
- FLJ12377, Bst1, SPG67
- MANE Select-transkript
- ENST00000354764.9NM_024989.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs PGAP1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Intellektuel funktionsnedsættelse
Et af 233 gener, der er knyttet til det
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er PGAP1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 11,1 kb af genets 93,7 kb; 2.769 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest PGAP1
30
positioner i PGAP1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 93,7 kb af PGAP1, inklusive introner, og ikke kun de 11,1 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 sygdom
- ADKadenosine kinaseDeler 1 sygdom
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 sygdom
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 sygdom
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 sygdom
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 sygdom
- ANK3ankyrin 3Deler 1 sygdom
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 sygdom
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 sygdom
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 sygdom
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 sygdom
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 sygdom
Træk knyttet til PGAP1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, PGAP1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Babinski sign
- Degeneration of cerebrum
- Delayed ability to roll over
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to walk
- Delayed CNS myelination
- Delayed speech and language development
- Disorder of involuntary muscle movements
Vis 23 træk mere
- Global developmental delay
- Increased reflexes
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
- Motor delay
- Repetitive movements
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Abnormality of movement
- Absent speech development
- Agenesis of corpus callosum
- Aplasia/Hypoplasia of the cerebellar vermis
- Brief seizures with staring spells
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed ability to crawl
- Enlarged sylvian cistern
- Grand mal seizures
- Inappropriate laughter
- Intellectual disability
- Intellectual disability, mild
- Limb tremor
Abnormality of head or neck
- Abnormal dentition
- Depressed nasal bridge
- Highly arched eyebrow
- Short neck
- Thin dental enamel
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Wide mouth
- Abnormally small head
Vis 3 træk mere
Abnormality of the musculoskeletal system
- Involuntary muscle stiffness, contraction, or spasm
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Low muscle tone
- Low muscle tone in trunk
- Lower limb spasticity
- Muscle degeneration
- Progressive spastic paraplegia
Vis 2 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). PGAP1-genet: post-GPI attachment to proteins inositol deacylase 1. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/pgap1
Dante Labs. PGAP1-genet: post-GPI attachment to proteins inositol deacylase 1 [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/pgap1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger