Gene
PRDM5
PR/SET domain 5
- HGNC 9349↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000138738↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 11107↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 4q27
- Coordinate
- Cromosoma 4: 120.691.915–120.922.726 (GRCh38)
- Esoni
- 16 esoni su 230,8 kb
- Proteina
- 630 amminoacidi
- Noto anche come
- PFM2
- Trascritto MANE Select
- ENST00000264808.8NM_018699.4
- Tipo di locus
- gene with protein product
- Molto alta
- Buona
- Bassa
- Molto bassa
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Sindrome di Ehlers-Danlos
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di PRDM5
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 5,2 kb dei 230,8 kb del gene; 1893 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge PRDM5
28
posizioni in PRDM5 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 230,8 kb di PRDM5, introni inclusi, non solo i 5,2 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2Condivide 1 condizione
- AEBP1AE binding protein 1Condivide 1 condizione
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 6Condivide 1 condizione
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 7Condivide 1 condizione
- C1Rcomplement C1rCondivide 1 condizione
- C1Scomplement C1sCondivide 1 condizione
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 14Condivide 1 condizione
- COL12A1collagen type XII alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL1A2collagen type I alpha 2 chainCondivide 1 condizione
- COL3A1collagen type III alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL5A1collagen type V alpha 1 chainCondivide 1 condizione
Tratti collegati a PRDM5
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che PRDM5 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene PRDM5: PR/SET domain 5. Consultato il 17 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/prdm5
Dante Labs. Gene PRDM5: PR/SET domain 5 [Internet]. [citato il 17 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/prdm5
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