Gene
COL12A1
collagen type XII alpha 1 chain
- HGNC 2188↗(si apre in una nuova scheda)
- Gene Ensembl ENSG00000111799↗(si apre in una nuova scheda)
- NCBI Gene 1303↗(si apre in una nuova scheda)
Sintesi
- Localizzazione citogenetica
- 6q13-q14.1
- Coordinate
- Cromosoma 6: 75.084.326–75.206.053 (GRCh38)
- Esoni
- 66 esoni su 121,7 kb
- Proteina
- 3063 amminoacidi
- Simboli precedenti
- COL12A1L
- Trascritto MANE Select
- ENST00000322507.13NM_004370.6
- Tipo di locus
- gene with protein product
Genoma di riferimentoGRCh38hg38
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Distrofie muscolari congenite
- Distrofia muscolare congenita
Un gruppo di distrofie muscolari con esordio alla nascita o nella prima infanzia, incluse le distroglicanopatie (come le forme correlate a FKRP, FKTN e POMT1/2).
- 4 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Sindrome di Ehlers-Danlos
- 3 segnalatori GenCC lo valutano come definitivo o forte
Struttura di COL12A1
- Sequenza codificante
- Regione non tradotta
- Introne
- Direzione della trascrizione
- Siti noti causativi di malattia
- Regioni che le letture brevi faticano a leggere
Esoni del trascritto MANE Select del gene (versione v1.5), da NCBI ed EMBL-EBI, sul genoma di riferimento GRCh38.
Bande cromosomiche dall'ideogramma GRCh38 di UCSC (2022-10-29).
Geni vicini dalla release 116 di Ensembl, su GRCh38.
Gli esoni costituiscono 11,7 kb dei 121,7 kb del gene; 9192 di queste basi codificano la proteina.
Come un test genomico legge COL12A1
109
posizioni in COL12A1 in cui ClinVar classifica una variante come patogena o probabilmente patogena
Nessuna di esse si trova in una regione che le letture brevi faticano a leggere.
Un genoma intero copre tutti i 121,7 kb di COL12A1, introni inclusi, non solo i 11,7 kb di esoni.
Geni associati alle stesse condizioni
- ADAMTS2ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 2Condivide 1 condizione
- AEBP1AE binding protein 1Condivide 1 condizione
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Condivide 1 condizione
- B3GALT6beta-1,3-galactosyltransferase 6Condivide 1 condizione
- B4GALT7beta-1,4-galactosyltransferase 7Condivide 1 condizione
- B4GAT1beta-1,4-glucuronyltransferase 1Condivide 1 condizione
- C1Rcomplement C1rCondivide 1 condizione
- C1Scomplement C1sCondivide 1 condizione
- CHKBcholine kinase betaCondivide 1 condizione
- CHST14carbohydrate sulfotransferase 14Condivide 1 condizione
- COL1A1collagen type I alpha 1 chainCondivide 1 condizione
- COL1A2collagen type I alpha 2 chainCondivide 1 condizione
Tratti collegati a COL12A1
L'Human Phenotype Ontology elenca questi come caratteristiche delle rare condizioni che COL12A1 può causare. La pagina di ciascun tratto elenca gli altri geni ad esso collegati.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Distal joint hypermobility
- Double-Jointed
- Flexed joint that cannot be straightened
- Hunched back
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Low muscle tone
- Muscle weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
Mostra altri 32 tratti
- Abnormal muscle fiber morphology
- EMG: myopathic abnormalities
- Generalized muscle weakness
- Increased endomysial connective tissue
- Increased wrist mobility
- Muscular dystrophy
- Progressive proximal muscle weakness
- Reduced muscle collagen VI
- Reduced spine movement
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Kyphoscoliosis
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Multiple joint contractures
- Muscle degeneration
- Muscle tissue disease
- Neck muscle weakness
- Scoliosis
- Weak diaphragm
- Weakness of outermost muscles
- Axial muscle weakness
- Congenital contracture
- Decreased muscle mass
- Excessive inward curvature of lower spine
- Funnel chest
- Gowers sign
- Prominent swayback
- Reduced maximal expiratory pressure
- Rimmed vacuoles
- Shoulder flexion contracture
- Difficulty running
Abnormality of limbs
- Increased laxity of fingers
- Ankle flexion contracture
- Elbow flexion contracture
- Hip dislocation
- Inability to straighten knee
- Interphalangeal joint contracture of finger
- Inward turned thumb
- Limb-girdle muscle weakness
Mostra altri 18 tratti
- Long toe
- Permanent flexion of the finger
- Pes valgus
- Quadriceps weakness
- Slender finger
- Wrist flexion contracture
- Club feet
- Congenital bilateral hip dislocation
- Congenital finger flexion contractures
- Contractures of the foot joints
- Curved toe bone
- Dropped arches
- Foot drop
- Joint contracture of the hand
- Partial knee cap dislocation
- Shortening of the achilles tendon
- Tapered finger
- Winged shoulder blade
Abnormality of head or neck
- Abnormality of the palate
- Bell's palsy
- High palate
- Little lower jaw
- Short neck
- Wry neck
- Congenital muscular torticollis
- High, narrow palate
Mostra altri 1 tratto
Abnormality of the nervous system
- Motor delay
- Stooped posture
- Abnormal gait
- Absent reflexes
- Delayed ability to stand
- Delayed ability to walk
- Delayed fine motor development
- Toe walking
Mostra altri 1 tratto
Link esterni
Schede genetiche
Trascritto
Proteina
Da dove provengono questi dati
- HGNC: il simbolo del gene, il nome, altri simboli e la posizione.
- MANE Select v1.5, da NCBI ed EMBL-EBI: il trascritto, i suoi esoni e la sequenza codificante.
- GenCC e ClinGen, rilasciati 2026-10-16: a quali condizioni è associato il gene e con quale forza.
- La lista ACMG dei reperti secondari, SF v3.2.
- ClinVar e le stratificazioni GIAB: siti noti associati a malattie e le regioni che le letture corte trovano difficili da analizzare.
- The Human Phenotype Ontology, versione 2026-09-01: i tratti collegati al gene. Scopri di più su hpo.jax.org.
- Rilascio dei dati 2026.10.16-c6eea6bf.
Cita questa pagina
Dante Labs. (s.d.). Gene COL12A1: collagen type XII alpha 1 chain. Consultato il 16 ottobre 2026, da https://dantelabs.com/it/genes/col12a1
Dante Labs. Gene COL12A1: collagen type XII alpha 1 chain [Internet]. [citato il 16 ottobre 2026]. Disponibile da: https://dantelabs.com/it/genes/col12a1
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