Gén
MFSD8
major facilitator superfamily domain containing 8
- HGNC 28486↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000164073↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 256471↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 4q28.2
- Koordináták
- 4. kromoszóma: 127 917 805–127 965 173 (GRCh38)
- Exonok
- 12 exon, összesen 47,4 kb
- Fehérje
- 518 aminosav
- Más néven ismert
- SLC74A1, MGC33302
- Korábbi jelölések
- CLN7
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000641686.2NM_001371596.2
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mfsd8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a MFSD8-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Age-Related Macular Degeneration
A progressive degeneration of the macula in older adults, occurring in dry (atrophic) and wet (neovascular) forms.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
AREDS2 supplementation; anti-VEGF injections (ranibizumab, aflibercept) for wet AMD; pegcetacoplan (Syfovre) for geographic atrophy; avacincaptad (Izervay) for GA; smoking cessation; blood pressure management; UV protection; low-vision rehabilitation
Neuronal Ceroid Lipofuscinosis
- Late Infantile Neuronal Ceroid LipofuscinosisAutoszomális recesszív
A genetically heterogeneous group of neuronal ceroid lipofuscinoses (NCLs) typically characterized by onset during infancy or early childhood with decline of mental and motor capacities, epilepsy, and vision loss through retinal degeneration.
- 5 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
- Autoszomális recesszív
A group of inherited progressive degenerative brain diseases characterized clinically by a decline of mental and other capacities, epilepsy, and vision loss through retinal degeneration, and histopathologically by intracellular accumulation of an autofluorescent material, ceroid lipofuscin, in the neuronal cells in the brain and in the retina.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 6 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
Átfogóbb csoportosítások
Inherited Neurodegenerative Disorders
- KIF5A-Related Neurodegenerative DisorderAutoszomális domináns
A 372 hozzá kapcsolódó gén egyike
Caused by changes in one copy of KIF5A, which encodes a motor protein with a cargo-binding tail. Different types of change lead to different conditions: hereditary spastic paraplegia type 10, an axonal form of Charcot-Marie-Tooth disease and amyotrophic lateral sclerosis (ALS).
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 6 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Care is symptomatic and depends on the presentation, including physiotherapy, antispasticity medicines and multidisciplinary ALS care. Each child of an affected person has a 1 in 2 chance of inheriting the change; genetic counselling helps families understand this.
Lysosomal Storage Disease
- Lysosomal storage disease (other and unspecified types)
A 59 hozzá kapcsolódó gén egyike
Covers lysosomal storage diseases without a dedicated report, such as Farber disease and other ASAH1-related disorders, prosaposin (PSAP) deficiencies, multiple sulfatase deficiency, mucopolysaccharidosis types IX and X, and Dorfman-Chanarin disease; inheritance varies by subtype, most often autosomal recessive.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: bizonyított
- 6 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
A MFSD8 felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 47,4 kb-jából 4,4 kb-ot tesznek ki; ezek közül 1557 bázis kódolja a fehérjét.
MFSD8 szekvenálása
4Könnyű
Mennyire nehéz a MFSD8 szekvenálása rövid olvasatokkal, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A MFSD8 exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.
Ami tovább nehezíti: a MFSD8 exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Súly: 100%.0%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genom más helyein lévő másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Súly: 60%.0%
- Shared with chrYThe pseudoautosomal regions and the X-transposed region, where chrX and chrY carry the same or nearly the same sequence, so reads from either may land on the other. Súly: 60%.0%
- Referencia-lefedettségA közeli referencia-összeszerelés hiányai, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Súly: 50%.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló ismétlések, amelyeken az olvasatok megcsúsznak, és amelyeket esetleg nem fognak át. Súly: 30%.3,6%
- GC-tartalomOlyan szakaszok, ahol a G és C bázisok aránya 25% alatti vagy 65% feletti, és amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Súly: 20%.13%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein nyugszik, a nehezen szekvenálható régiókat mutatja be.Így számítjuk kiMinden oszlop a MFSD8 exonbázisainak azon arányát mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában is nehézzé teheti a gént, a további típusok azonban egyre kevesebbet adnak hozzá: 0, ha egy bázis sem esik egyik típusba sem, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
141
a MFSD8 génben azok a pozíciók, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősít egy változást
Ezek közül egy sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
A teljes genomszekvenálás a MFSD8 mind a 47,4 kb-os hosszát lefedi, beleértve az intronokat is, nem csak az exonok 4,4 kb-át.
ClinVar pathogenic variants (152)
The MFSD8 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 77
- Patogén/valószínűleg patogén 12
- Valószínűleg patogén 63
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1437G>A (p.Trp479Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1420C>T (p.Gln474Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1141G>T (p.Glu381Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1102G>C (p.Asp368His) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1064T>G (p.Leu355Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.979del (p.Val327fs) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.894T>G (p.Tyr298Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.863+1G>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.754+2T>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.616C>T (p.Gln206Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.600G>A (p.Trp200Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.217dup (p.Thr73fs) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.103C>T (p.Arg35Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.63-1G>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1444C>T (p.Arg482Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1361T>C (p.Met454Thr) (opens in a new tab) | inherited retinal dystrophy and 4 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1350+2T>C (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1235C>T (p.Pro412Leu) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 3 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1213C>T (p.Gln405Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1124del (p.Pro375fs) (opens in a new tab) | macular dystrophy with central cone involvement and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.910C>T (p.Gln304Ter) (opens in a new tab) | macular dystrophy with central cone involvement and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.881C>A (p.Thr294Lys) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.864-1G>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.754+1G>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.198+2T>C (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogén/valószínűleg patogén | ★★★★2 csillag a 4-ből kritériumok megadva, több beküldő, nincs ellentmondás |
See all 152 with every other MFSD8 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthase4 betegséget oszt meg
- CLN6CLN6 transmembrane ER protein4 betegséget oszt meg
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 63 betegséget oszt meg
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, battenin3 betegséget oszt meg
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC protein3 betegséget oszt meg
- CTSDcathepsin D3 betegséget oszt meg
- CTSFcathepsin F3 betegséget oszt meg
- DNAJC5DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C53 betegséget oszt meg
- GRNgranulin precursor3 betegséget oszt meg
- KCTD7potassium channel tetramerization domain containing 73 betegséget oszt meg
- PPT1palmitoyl-protein thioesterase 13 betegséget oszt meg
- TPP1tripeptidyl peptidase 13 betegséget oszt meg
A(z) MFSD8 génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) MFSD8 gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the eye
- Blind spot located at fixation point
- Decreased clarity of vision
- Macular dystrophy
- Visual impairment
- Abnormal retinal pigmentation
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Red green color blindness
Még 17 tulajdonság megjelenítése
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bull's eye maculopathy
- Color blindness
- Optic disc pallor
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Severe near sightedness
- Spicular pigmentation of the retina
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Metamorphopsia
- Perifoveal ring of hyperautofluorescence
- Blindness
- Noninflammatory retina disease
- Optic atrophy
- Pigmentary retinopathy
- Visual loss
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-18 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.18-8b139e39.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). MFSD8 gén: major facilitator superfamily domain containing 8. Lekérve: 2026. október 19., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/mfsd8
Dante Labs. MFSD8 gén: major facilitator superfamily domain containing 8 [Internet]. [idézve: 2026. október 19.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/mfsd8
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt