Ugrás a tartalomhoz
Használja fel HSA- vagy FSA-keretét
Szekvenálja genomját (új lapon nyílik meg)

Gén

HSPA4L

heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like

Összefoglalás

Citogenetikai elhelyezkedés
4q28.1
Koordináták
4. kromoszóma: 127 782 322–127 840 733 (GRCh38)
Exonok
19 exon, összesen 58,4 kb
Fehérje
839 aminosav
Más néven ismert
APG-1, Osp94, HSPH3
MANE Select transzkriptum
ENST00000296464.9NM_014278.4
Lokusz típusa
Fehérjét kódoló
  • Nagyon magas
  • Megbízható
  • Alacsony
  • Nagyon alacsony

Ehhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések

A Genome Test egyik jelentése sem olvassa a(z) HSPA4L gént. A teszt az egész genomot szekvenálja, így az Ön adatai ennek ellenére tartalmazzák.

A HSPA4L felépítése

  • Kódoló szekvencia
  • Transzlálatlan régió
  • Intron
  • A transzkripció iránya
  • Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
4. kromoszóma, a HSPA4L helyét zárójel jelöli. A HSPA4L és környékén 7 gén a 4. kromoszómán, 127 311 528–128 311 527 között.4. kromoszóma4q28.1p16.3p16.2p16.1p15.33p15.32p15.31p15.2p15.1p14p13p12p11q11q12q13.1q13.2q13.3q21.1q21.21q21.22q21.23q21.3q22.1q22.2q22.3q23q24q25q26q27q28.1q28.2q28.3q31.1q31.21q31.22q31.23q31.3q32.1q32.2q32.3q33q34.1q34.2q34.3q35.1q35.2127,4 Mb127,6 Mb127,8 Mb128 Mb128,2 MbINTU: 127 623 271–127 726 737, előre szálINTUSLC25A31: 127 730 400–127 774 292, előre szálSLC25A31HSPA4L: 127 782 322–127 840 733, előre szálHSPA4LPLK4: 127 880 890–127 899 224, előre szálPLK4MFSD8: 127 917 799–127 966 034, fordított szálMFSD8ABHD18: 127 965 252–128 039 953, előre szálABHD18LARP1B: 128 060 638–128 222 931, előre szálLARP1BPGRMC2: 128 268 172–128 288 834, fordított szálPGRMC2A HSPA4L ábrája: 19 exon a(z) 4. kromoszóma előre szálán1. exon: 127 782 322–127 782 657, 336 bázis2. exon: 127 794 077–127 794 134, 58 bázis3. exon: 127 795 768–127 795 908, 141 bázis4. exon: 127 798 587–127 798 709, 123 bázis5. exon: 127 801 138–127 801 237, 100 bázis6. exon: 127 801 785–127 801 918, 134 bázis7. exon: 127 803 629–127 803 873, 245 bázis8. exon: 127 804 011–127 804 087, 77 bázis9. exon: 127 805 073–127 805 224, 152 bázis10. exon: 127 805 687–127 805 793, 107 bázis11. exon: 127 807 996–127 808 129, 134 bázis12. exon: 127 811 437–127 811 636, 200 bázis13. exon: 127 818 325–127 818 420, 96 bázis14. exon: 127 820 428–127 820 565, 138 bázis15. exon: 127 822 769–127 822 894, 126 bázis16. exon: 127 823 517–127 823 624, 108 bázis17. exon: 127 827 305–127 827 424, 120 bázis18. exon: 127 830 638–127 830 799, 162 bázis19. exon: 127 832 683–127 840 733, 8051 bázis124681012141618195′3′

A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.

Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).

Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.

Az exonok a gén 58,4 kb-jából 10,6 kb-ot tesznek ki; ezek közül 2520 bázis kódolja a fehérjét.

HSPA4L szekvenálása

6Könnyű

Mennyire nehéz a HSPA4L rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból

A HSPA4L exonjainak szinte mindegyike olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok tisztán leképezhetők.

Ehhez hozzájárul: a HSPA4L exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban

  • Leképezhetőség2,4%
  • Homológia0%
  • Közös a chrY-nal0%
  • Referencia-lefedettség0%
  • Ismétlődések4,7%
  • GC-tartalom9,2%

A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk ki

Külső hivatkozások

Az adatok forrásai

  • HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
  • MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
  • A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.

Az oldal idézése

APA

Dante Labs. (n.d.). HSPA4L gén: heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/hspa4l

Vancouver

Dante Labs. HSPA4L gén: heat shock protein family A (Hsp70) member 4 like [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/hspa4l

Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.

449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt

Kérem a Genome Testemet