Genas
MFSD8
major facilitator superfamily domain containing 8
- HGNC 28486↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000164073↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 256471↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 4q28.2
- Koordinatės
- Chromosoma 4: 127 917 805–127 965 173 (GRCh38)
- Eksonai
- 12 eksonų per 47,4 kb
- Baltymas
- 518 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- SLC74A1, MGC33302
- Ankstesni simboliai
- CLN7
- MANE Select transkriptas
- ENST00000641686.2NM_001371596.2
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mfsd8.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite MFSD8 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Senatvę lemiantis geltonosios dėmės degeneracija
Progresuojanti geltonosios dėmės degeneracija vyresniems suaugusiesiems, pasireiškianti sausąja (atrofine) ir drėgnąja (neovaskuline) formomis.
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
AREDS2 papildai; anti-VEGF injekcijos (ranibizumabas, aflibercept) drėgnajai AMD gydyti; pegcetapleinas (Syfovre) geografinei atrofijai gydyti; avacinkaptadas (Izervay) GA gydyti; rūkymo nutraukimas; kraujospūdžio kontrolė; apsauga nuo UV spindulių; mažo regėjimo reabilitacija
Neuronų ceroido lipofuscinozė
- Vėlyvosios kūdikystės neuronų ceroido lipofuscinozėAutosominis recesyvinis
Genetiškai heterogeniška neuronų ceroido lipofuscinozių (NCL) grupė, paprastai pasireiškianti kūdikystėje arba ankstyvoje vaikystėje protinių ir motorinių gebėjimų silpnėjimu, epilepsija ir regėjimo netekimu dėl tinklainės degeneracijos.
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
- Autosominis recesyvinis
Paveldimų progresuojančių degeneracinių smegenų ligų grupė, klinikiniu požiūriu pasireiškianti protinių ir kitų gebėjimų silpnėjimu, epilepsija ir regėjimo netekimu dėl tinklainės degeneracijos, o histopatologiškai – autofluorescencinės medžiagos, ceroido lipofuscino, kaupimusi neuronų ląstelėse smegenyse ir tinklainėje.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Platesnės grupės
Paveldimos neurodegeneracinės ligos
- Su KIF5A susijusi neurodegeneracinė ligaAutosominis dominantinis
Vienas iš 372 su juo susijusių genų
Ją sukelia pokyčiai viename KIF5A geno egzemplioriuje. Šis genas koduoja motorinį baltymą su krovinį surišančia uodega. Skirtingų tipų pokyčiai sukelia skirtingas ligas: paveldimą spastinę paraplegiją 10 tipo, aksoninę Charcot-Marie-Tooth ligos formą ir amiotrofinę šoninę sklerozę (ALS).
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Gydymas simptominis ir priklauso nuo ligos pasireiškimo. Jis apima fizioterapiją, vaistus nuo spastiškumo ir daugiadisciplininę ALS priežiūrą. Kiekvienas vaiko, kuriam perduotas pakitimas, turi 1 iš 2 tikimybę jį paveldėti. Genetinis konsultavimas padeda šeimoms tai suprasti.
Lizosominė kaupimo liga
- Lizosomų kaupimosi liga (kiti ir nepatikslinti tipai)
Vienas iš 59 su juo susijusių genų
Apima lizosomų kaupimosi ligas, kurioms nėra atskiros ataskaitos, pavyzdžiui, Farbero ligą ir kitus su ASAH1 susijusius sutrikimus, prosapozino (PSAP) trūkumus, daugybinį sulfatazių trūkumą, mukopolisacharidozės IX ir X tipus bei Dorfmano-Chanarino ligą. Paveldėjimo tipas priklauso nuo poformio, dažniausiai autosominis recesyvinis.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 6 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas MFSD8
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,4 kb iš 47,4 kb geno; 1 557 šių bazių koduoja baltymą.
MFSD8 sekvenavimas
4Lengva
Kaip sunku sekvenuoti MFSD8 trumpaisiais skaitiniais, iš 100
0 · Lengva100 · Sunku
Beveik visi MFSD8 eksonai yra vietose, kur trumpieji skaitiniai atvaizduojami aiškiai.
Dar prisideda: kiekvienos rūšies sunkių sričių dalis tarp MFSD8 eksonų
- AtvaizduojamumasRuožai, kur 100 ar 250 bp skaitiniai negali būti vienareikšmiškai susieti, todėl ten iškvietimas gali būti praleistas arba klaidingas. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 100 balų.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kitose genomo vietose, pavyzdžiui, paralogai ir pseudogenai, kurių identiškumas 90 % ar didesnis. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 60 balų.0 %
- Bendra su chrYPseudoautosominiai regionai ir X perkelta sritis, kur chrX ir chrY turi tą pačią arba beveik tą pačią seką, todėl skaitinys iš vieno gali būti susietas su kitu. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 60 balų.0 %
- Nuorodinės sekos aprėptisNetoliese esantys spragos nuorodinėje sekoje, kur skaitiniams nėra su kuo lygiuotis. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 50 balų.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido ilgos sekos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neperdengti jų. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 30 balų.3,6 %
- GC kiekisLangai, kuriuose G ir C yra mažiau nei 25 % arba daugiau nei 65 %, bibliotekos paruošimo metu apimami menkai. Vien pati, visiškai tokio tipo srityje esantis genas gautų 20 balų.13 %
„Dante Labs“ rezultatas, sudarytas remiantis mūsų pačių tyrimais ir NIST „Genome in a Bottle“ sunkiai sekvenuojamų sričių žemėlapiais.Kaip skaičiuojamaKiekvienas stulpelis rodo MFSD8 eksonų bazių dalį tos rūšies sunkioje srityje. Bet kuri viena rūšis gali pati savaime padaryti geną sunkiai sekvenuojamu, o kiekviena papildoma rūšis prideda vis mažiau: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokią, 100, kai kiekviena bazė yra vietoje, kur skaitiniai negali būti vienareikšmiškai susieti.
141
MFSD8 pozicija, kurioje ClinVar pakeitimą priskiria patogeniniam arba tikriausiai patogeniniam
Nė viena jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai nuskaito.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 47,4 kb MFSD8 geno, įskaitant intronus, o ne tik 4,4 kb eksonų.
ClinVar pathogenic variants (152)
The MFSD8 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeninis 77
- Patogeninis / tikriausiai patogeninis 12
- Tikriausiai patogeninis 63
| Variantas | Conditions | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1437G>A (p.Trp479Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1420C>T (p.Gln474Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1141G>T (p.Glu381Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1102G>C (p.Asp368His) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1064T>G (p.Leu355Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.979del (p.Val327fs) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.894T>G (p.Tyr298Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.863+1G>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.754+2T>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.616C>T (p.Gln206Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.600G>A (p.Trp200Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.217dup (p.Thr73fs) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.103C>T (p.Arg35Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.63-1G>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1444C>T (p.Arg482Ter) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1361T>C (p.Met454Thr) (opens in a new tab) | inherited retinal dystrophy and 4 others | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1350+2T>C (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1235C>T (p.Pro412Leu) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 3 others | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1213C>T (p.Gln405Ter) (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.1124del (p.Pro375fs) (opens in a new tab) | macular dystrophy with central cone involvement and 1 other | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.910C>T (p.Gln304Ter) (opens in a new tab) | macular dystrophy with central cone involvement and 1 other | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.881C>A (p.Thr294Lys) (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 1 other | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.864-1G>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.754+1G>A (opens in a new tab) | late infantile neuronal ceroid lipofuscinosis and 2 others | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
| NM_001371596.2(MFSD8):c.198+2T>C (opens in a new tab) | neuronal ceroid lipofuscinosis 7 | Patogeninis / tikriausiai patogeninis | ★★★★2 žvaigždučių iš 4 kriterijai pateikti, keli pateikėjai, prieštaravimų nėra |
See all 152 with every other MFSD8 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseTuri 4 bendrų būklių
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinTuri 4 bendrų būklių
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Turi 3 bendrų būklių
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninTuri 3 bendrų būklių
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinTuri 3 bendrų būklių
- CTSDcathepsin DTuri 3 bendrų būklių
- CTSFcathepsin FTuri 3 bendrų būklių
- DNAJC5DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member C5Turi 3 bendrų būklių
- GRNgranulin precursorTuri 3 bendrų būklių
- KCTD7potassium channel tetramerization domain containing 7Turi 3 bendrų būklių
- PPT1palmitoyl-protein thioesterase 1Turi 3 bendrų būklių
- TPP1tripeptidyl peptidase 1Turi 3 bendrų būklių
Savybės, susijusios su MFSD8
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti MFSD8, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the eye
- Blind spot located at fixation point
- Decreased clarity of vision
- Macular dystrophy
- Visual impairment
- Abnormal retinal pigmentation
- Difficulties with night vision
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Red green color blindness
Rodyti dar 17 savybių
- Abnormal color vision
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bull's eye maculopathy
- Color blindness
- Optic disc pallor
- Progressive loss of vision
- Retinal atrophy
- Severe near sightedness
- Spicular pigmentation of the retina
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Metamorphopsia
- Perifoveal ring of hyperautofluorescence
- Blindness
- Noninflammatory retina disease
- Optic atrophy
- Pigmentary retinopathy
- Visual loss
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-19: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.19-9814e911.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). MFSD8 genas: major facilitator superfamily domain containing 8. Pasiekta 2026 m. spalio 19 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/mfsd8
Dante Labs. MFSD8 genas: major facilitator superfamily domain containing 8 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 19 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/mfsd8
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites