Gène
ACTG2
actin gamma 2, smooth muscle
- HGNC 145↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000163017↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 72↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 2p13.1
- Coordonnées
- Chromosome 2 : 73 893 008–73 919 865 (GRCh38)
- Exons
- 9 exons sur 26,9 kb
- Protéine
- 376 acides aminés
- Aussi appelé
- ACTSG
- Symboles précédents
- ACTL3, ACTA3
- Transcrit MANE Select
- ENST00000345517.8NM_001615.4
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Myopathie viscérale héréditaire, CIPO et MMIHS
- Myopathie viscérale familialeAutosomique dominant
Une maladie du muscle lisse de l'intestin et de la vessie, le plus souvent causée par des variants de ACTG2, qui surviennent fréquemment de novo chez la personne atteinte.
- 2 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Un diagnostic génétique peut éviter des interventions chirurgicales abdominales inutiles et guider la prise en charge nutritionnelle et vésicale.
Structure de ACTG2
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 1,5 kb sur les 26,9 kb du gène ; 1 131 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de ACTG2
0Faible
Difficulté de séquençage de ACTG2 avec des lectures courtes, sur 100Chaque barre représente la part des bases d'exons de ACTG2 situées dans ce type de région difficile. Le score les pondère selon le coût de chacune pour un appel en lecture courte : 0 lorsqu'aucune base ne se trouve dans une telle région, 100 lorsque chaque base se trouve dans toutes.
- CartographiabilitéZones où des lectures de 100 ou 250 pb ne peuvent pas être placées de façon unique, si bien qu'un appel à cet endroit peut être manquant ou erroné. Poids 35 %.0 %
- HomologieDuplications segmentaires : copies ailleurs dans le génome, comme les paralogues et les pseudogènes, à 90 % d'identité ou plus. Poids 30 %.0 %
- RépétitionsRépétitions en tandem et séquences d'une même base, sur lesquelles les lectures glissent et qu'elles peuvent ne pas couvrir entièrement. Poids 15 %.0 %
- Teneur en GCFenêtres dont le taux de G et de C est inférieur à 25 % ou supérieur à 65 %, que la préparation de la bibliothèque couvre mal. Poids 10 %.0 %
- Couverture de référenceLacunes de l'assemblage de référence à proximité, où il n'existe aucune séquence sur laquelle les lectures peuvent s'aligner. Poids 10 %.0 %
25
positions dans ACTG2 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à couvrir.
Un génome complet couvre les 26,9 kb de ACTG2, introns compris, et pas seulement les 1,5 kb d'exons.
Traits associés à ACTG2
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que ACTG2 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the digestive system
- Intestinal malrotation
- Megaduodenum
- Microcolon
- Abdominal bloating
- Hypoperistalsis
- Nausea and vomiting
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Absent/small abdominal wall muscles
Afficher 15 traits supplémentaires
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-17 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- Les stratifications du génome Genome in a Bottle, publiées par le NIST : le score de difficulté de séquençage.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.17-8666dff2.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène ACTG2 : actin gamma 2, smooth muscle. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/actg2
Dante Labs. Gène ACTG2 : actin gamma 2, smooth muscle [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/actg2
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