Geeni
NIPA1
NIPA magnesium transporter 1
- HGNC 17043↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000170113↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 123606↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 15q11.2
- Koordinaatit
- Kromosomi 15: 22 786 644–22 829 789 (GRCh38)
- Eksonit
- 5 eksonia 43,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 329 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- MGC35570, SLC57A1
- Aiemmat symbolit
- SPG6
- MANE Select -transkripti
- ENST00000337435.9NM_144599.5
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue NIPA1 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Perinnöllinen spastinen paraplegia
- Perinnöllinen spastinen paraplegia (kaikki tyypit)
Yksi 66 siihen liittyvästä geenistä
Yhteisnimitys kaikille perinnöllisille spastisille paraplegioille, mukaan lukien SPG4 (SPAST), yleisin dominantti muoto, sekä SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 ja SPG31.
- 2 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
NIPA1-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 6,6 kb geenin 43,1 kb:stä; 990 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä NIPA1
3
NIPA1-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 43,1 kb geenistä NIPA1, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 6,6 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Yhteinen sairaus: 1
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseYhteinen sairaus: 1
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Yhteinen sairaus: 1
- AMFRautocrine motility factor receptorYhteinen sairaus: 1
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Yhteinen sairaus: 1
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Yhteinen sairaus: 1
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Yhteinen sairaus: 1
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Yhteinen sairaus: 1
- ATL1atlastin GTPase 1Yhteinen sairaus: 1
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin NIPA1 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita NIPA1 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Impaired vibratory sensation
- Overactive lower leg reflex
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Delayed speech and language development
Näytä 23 piirrettä lisää
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Intellectual disability
- Memory impairment
- Motor delay
- Reading disability
- Thick cerebral cortex
- Ataxia
- Autism
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Epilepsy
- Incoordination
- Postural tremor
- Schizophrenia
- Self-injurious behavior
- Short attention span
- Tremor
- Dilated fourth ventricle
- Clonus
- Degeneration of the lateral corticospinal tracts
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Increased reflexes
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). NIPA1-geeni: NIPA magnesium transporter 1. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/nipa1
Dante Labs. NIPA1-geeni: NIPA magnesium transporter 1 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/nipa1
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa