Gen
NIPA1
NIPA magnesium transporter 1
- HGNC 17043↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000170113↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 123606↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 15q11.2
- Koordinater
- Kromosom 15: 22 786 644–22 829 789 (GRCh38)
- Exoner
- 5 exoner på 43,1 kb
- Protein
- 329 aminosyror
- Även känd som
- MGC35570, SLC57A1
- Tidigare symboler
- SPG6
- MANE Select-transkript
- ENST00000337435.9NM_144599.5
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs NIPA1, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Hereditär spastisk paraplegi
- Hereditär spastisk paraplegi (alla typer)
En av 66 gener kopplade till den
Samlingsbegrepp för alla hereditära spastiska paraplegier, inklusive SPG4 (SPAST), den vanligaste dominanta formen, samt SPG5A, SPG6, SPG10, SPG18, SPG30 och SPG31.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Så är NIPA1 uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 6,6 kb av genens 43,1 kb, och 990 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest NIPA1
3
positioner i NIPA1 där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 43,1 kb av NIPA1, med introner inräknade, inte bara de 6,6 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
- ABCD1ATP binding cassette subfamily D member 1Delar 1 tillstånd
- ABHD16Aabhydrolase domain containing 16A, phospholipaseDelar 1 tillstånd
- ALDH18A1aldehyde dehydrogenase 18 family member A1Delar 1 tillstånd
- AMFRautocrine motility factor receptorDelar 1 tillstånd
- AP4B1adaptor related protein complex 4 subunit beta 1Delar 1 tillstånd
- AP4E1adaptor related protein complex 4 subunit epsilon 1Delar 1 tillstånd
- AP4M1adaptor related protein complex 4 subunit mu 1Delar 1 tillstånd
- AP4S1adaptor related protein complex 4 subunit sigma 1Delar 1 tillstånd
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Delar 1 tillstånd
- ARL6IP1ARL6 interacting reticulophagy regulator 1Delar 1 tillstånd
- ATL1atlastin GTPase 1Delar 1 tillstånd
- ATP13A2ATPase cation transporting 13A2Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till NIPA1
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som NIPA1 kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Babinski sign
- Impaired vibratory sensation
- Overactive lower leg reflex
- Attention deficit
- Behavioral abnormality
- Brain imaging abnormality
- Delayed speech and language development
Visa ytterligare 23 egenskaper
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Intellectual disability
- Memory impairment
- Motor delay
- Reading disability
- Thick cerebral cortex
- Ataxia
- Autism
- Autism spectrum disorder
- Balance impairment
- Epilepsy
- Incoordination
- Postural tremor
- Schizophrenia
- Self-injurious behavior
- Short attention span
- Tremor
- Dilated fourth ventricle
- Clonus
- Degeneration of the lateral corticospinal tracts
- Impaired vibration sensation in the lower limbs
- Increased reflexes
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). NIPA1-genen: NIPA magnesium transporter 1. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/nipa1
Dante Labs. NIPA1-genen: NIPA magnesium transporter 1 [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/nipa1
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor